血液队列 QC 蛋白质组

Quantification depth

队列定量深度

Protein group 与多肽两种层级使用同一组样品、原始 Condition 和 log2 计算规则。

Per-sample depth

单样品定量 protein groups

样品按编号排列

Ranked Protein Groups

Protein group 丰度 Rank

按 28 个 QC 样品的中位 log2 PG.Quantity 从高到低排列全部 protein groups；搜索可高亮 accession、Gene、Protein ID 或蛋白名称。

候选蛋白搜索

Quantitative metrics

定量统计指标

正定量值统一进行 log2 转换。Feature 缺失率按未检出样品比例计算；CV、归一化、相关性和丰度分箱使用同一层级的定量矩阵。

Feature missingness

蛋白缺失率分布

CV threshold

QC 蛋白 log2 CV＜20%

CV distribution

蛋白 log2 CV 分布

CVs Below X

Protein group CV 阈值累计比例

Normalization

样品中位 log2 定量校正量

Binned Identifications

单样品检出 Protein groups 分箱

Binned CV

丰度分箱与 Protein group CV

Sample Correlation

Protein group 样品相关性

Pearson · log2 定量

Quantitative Heatmap

Protein group 整体定量热图

正在载入完整矩阵…

横轴为样品，纵轴为当前层级的全部 features；颜色表示实际 log2 定量，浅灰色表示未检出。

Feature

——浅灰色：未检出

Original groups & batch effect

原始分组与 PCA 批次校正

按原始 Condition 对 28 个样品分类。两张 PCA 的 PC1 与 PC2 均固定为 −100～100；校正后逐蛋白减去组内均值并回加总体均值。

Before correction

批次校正前

After correction

批次校正后

Sample-level review

样品 QC 表

样品按编号升序显示；筛选和排序只作用于当前表格，不改变项目级统计。

搜索样品原始组排序每页

样品	原始组	定量 protein groups	中位 log2 PG.Quantity

Protein evidence browser

蛋白、多肽与序列覆盖

从 protein group 查看多肽和 precursor 明细；选择蛋白后查看 UniProt 序列及肽段位置覆盖。

搜索原始组检出覆盖每页

在蛋白表中选择一个 protein group，可查看肽段、precursor 和序列覆盖。