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项目概览 Run 定量概览 QC 与定量搜库参数 TIC/BPC TIMS IM 谱图库蛋白表序列覆盖 MS2 与 XIC 图表导出数据说明

尿液队列蛋白质组 Demo

尿蛋白质组学高通量自动化处理结果Demo

Project overview

Project Summary

正在载入项目概览。

打开原始报告

Summary metrics

项目概览指标

Run overview

Run 定量概览

QC and quantitative analysis

QC 与定量

展示 run 级定量、PCA、相关性、丰度分布、CV 与组内/组间定量分析。

Search parameters and methods

搜库参数与 Methods 文本

展示本项目可读取的 Spectronaut 搜库、FDR、修饰、定量与导出参数，并生成可直接用于项目材料的方法学文本。

样品色谱 QC

样品 TIC / BPC 与全局重叠

按样品查看 TIC/BPC；相关数据未就绪时，该模块显示为待准备。

显示范围扫描级别图形类型 Y 轴图宽 px 图高 px TIC 颜色 BPC 颜色 BPC 标注颜色显示 BPC 峰标注 BPC 标注数自定义标注 X 轴缩放 X 轴平移 Y 轴缩放

timsTOF ion mobility

timsTOF IM 与帧级 TIC/BPC

正在载入 timsTOF .d QC 数据。

Run 视图 Frame 类型图宽 px 图高 px

Library browser

谱图库浏览与参考碎片谱图

正在载入 Spectronaut library。

library reference

展开

Library 表内检索

Protein browser

蛋白浏览

蛋白表视图

Protein abundance

蛋白丰度排序分布

按总体或单个 run 显示 protein group 的 rank-abundance 分布。

展开

正在载入蛋白丰度排序模块。

Sequence coverage

蛋白序列覆盖

已覆盖残基当前 peptide 未定位 peptide

Coverage 视图

样品 coverage 对比

默认选择前 10 个样品

每行氨基酸数每行 100 aa；同时作用于样品对比与常规 coverage；coverage 区域高度限制 400px。

Peptide 表内检索

Spectrum evidence

匹配碎片谱图与 precursor 证据

选择 peptide 后载入对应 precursor。

matched fragments

Precursor / spectrum

b ions y ions other library b ions library y ions library other 线宽字体标签阈值图宽 px 图高 px

谱图来源 Spectronaut matched 原始 MS2 证据 Library reference

Y 轴显示标签显示排除峰

作图标注选项

显示 tolerance window 使用 calibrated m/z Peak label Mass error unit Tolerance ppm Min fragment length Max fragment length Min fragment charge Max fragment charge

Fragment type a b c x y z other

Neutral losses No loss NH3 H2O H3PO4 C8H13NO5 Other losses

X 轴缩放倍数 X 轴平移 Y 轴缩放倍数完整 m/z 范围

谱图导出队列

可将当前项目具备的数据图加入队列，并一次下载为 ZIP。

0 / 100

SVG PNG PDF TSV

尚未加入待导出的证据。

尚无可导出的图形。

XIC viewer

提取离子流色谱图

若当前 precursor 存在提取离子流证据，将载入对应 MS1 / MS2 trace。

Trace 类型按 trace 归一化图宽 px 图高 px

Data notes

数据准备说明

本报告按 precursor 标识联动前体级 MS1 / MS2 提取离子流色谱。若结果不含碎片离子强度，MS/MS 匹配谱图仅显示 precursor 上下文；原始 MS2 证据未接入时，相应谱图来源不可用。