主办单位的心声:
目前在蛋白质组学行业,采用的最多的定量方法是TMT和ITRAQ,这些方法都是基于DDA即数 据依赖性采集策略。很多对质谱比较熟悉的朋友,会问我们一些问题,大体都集中在蛋白质数据重复性太差,标记试剂费用太贵导致只能合并珍贵的临床样本检测,数据分析太难等几个方面。这也让我们陷入了思考:究竟怎么样能让手中的先进质谱充分发挥其高分辨、高速度、高灵敏度的优势,能够像测序、芯片领域那样检测海量的生物学样本?我们特别请来了质谱领域绝对领导者Thermo Fisher公司和SWATH/DIA数据处理先驱Biognosys公司,一个是硬件领先,一个是软件领先,都是行业中的先驱者。我们希望通过这次会议,让更多人学到了有关蛋白质组学的理论和应用,并通过改进目前的分析策略,让数据物尽其用。
-----------上海易算生物科技有限公司 CEO 沈诚频

10月27~28日,由蛋白质谱仪绝对领导者ThermoFisher公司和DIA数据处理先驱Biognosis公司联合技术讲座-蛋白质组学样本数字化应用研讨会及培训班分别在中山医院和赛默飞中国总部顺利举行。
上海易算生物科技有限公司 ( OmicSolution )作为本次研讨会的主办单位之一,与癌变与侵袭原理教育部重点实验室一起,为来自全国各地的五十多名科研工作者,医学院专家, 献上了精彩的内容。
在第一天的研讨会总共有两场报告。分别对DIA技术进行了科普性介绍和对Biognosys产品、软件进行了详细的案例介绍和操作培训。对未来的蛋白质组学应用于数字化样本库建设、疾病大数据的规模化发现与验证方面,如何记录样本中的所有蛋白质信息,产生动态范围更广的数据,保证海量蛋白质组数据的产出质量。这些都是蛋白组学新一代技术所面临的最广泛的问题。
在第二天的环节是由来自Biognosys的Fadi博士,带领大家一起,对基于DIA技术(data independent acquisition)的下一代蛋白质组学技术数据分析进行操作培训、案例介绍, 来自上海交通大学,复旦大学,华东师范大学,中科院,华大蛋白等二十多名学员参加。
精彩瞬间

张伟博士现场报告
赛默飞世尔科技(Thermo Fisher Scientific)转化医学业务发展经理,张伟博士在蛋白质领域有10年的研究经验以及5年的市场经验,本人发表的第一作者SCI文章超过10篇。他从整个蛋白质组当前发展状况,国家项目支持进展等方面,给大家介绍了蛋白质组学样本数字化技术的广泛应用前景。

Fadi Abdi 博士现场报告
Fadi博士毕业于哈佛,目前在蛋白质组学行业先驱Biognosis公司担任全球事业部经理, 是本次会议的报告人之一。蛋白质组样本数字化技术实现的瓶颈主要在于质谱仪器性能与大数据分析能力两方面。 Fadi博士给大家介绍了在一次实验中实现1000种以上蛋白质的高重复性及准确定量的方法,技术特点以及案例。

报告现场
来自上海交通大学,复旦大学,华东师范大学,中科院,华大蛋白等学员认真听讲。

Fadi Abdi 博士现场培训
在第二天的现场培训环节,由Fadi博士详细深入介绍了Spectronaut™软件,培训学员们分析新一代DIA蛋白质组学的高通量数据。基于DIA策略的蛋白质组学方法在Spectronaut平台上结合IRT技术可以实现2min/run的超高分析速度和定量精确度,得到的数据量有了质的飞跃。后续的数据分析不再成为该领域的瓶颈。Fadi博士在培训中,也分享了自己的一系列经验。
matchOmicsolution致力于蛋白质组学新技术、新方法在中国的推广和实践。我们团队成员拥有超过10年的蛋白质组学信息技术、仪器技术和实验技术经验。与赛默飞世尔蛋白质组学团队紧密合作,为国内蛋白质组学实验室快速吸收、发展国际先进软硬件技术保驾护航。
同时我们拥有行业最先进的Thermo Scientific™ Q Exactive™质谱仪,Orbitrap Fusion™ Tribrid™质谱仪等分析平台,可满足客户的不同需求。
目前我们的团队成员来自于复旦大学蛋白质组学中心、上海交通大学系统生物研究院、中科院上海生命科学研究院等院校机构,从2005年起就从事蛋白质组学及信息学研究,我们的技术团队经验丰富、创新进取,紧跟学术界最新发展。
更多蛋白质组学技术信息请参阅我们的官方网站:
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