什么物质是生命现象的直接体现者,同时也是各种细胞功能的重要执行者?蛋白质。
然而实际上,蛋白质组学在精准医疗上的地位,却远远不及基因组高。当涉及到肿瘤机制研究和致病靶点筛选上,基因组变异的因素往往被排在前面。
比如肺癌,最常见的两个病理亚型是肺腺癌和肺鳞癌。当拿到病理报告,患者家属看到“肺鳞癌”的字眼,会有人提醒“没有靶向药可以吃”,因为基因检测”没发现什么突变“。但是等等,蛋白质检测也许会帮他们重新获得靶向机会。
这是怎么回事儿呢?今年8月份,美国临床蛋白质组学肿瘤分析联盟(缩写为CPTAC)的研究人员通过测定迄今为止最全面的肺鳞癌蛋白质组学图谱,发现了潜在的治疗新靶点和新药物,并率先在Cell期刊上率先发表此研究。
【RESOURCE| VOLUME184, ISSUE 16, P4348-4371.E40, AUGUST 05, 2021】
文章很长,但是对于蛋白质组学来说,重要的发现有三点:
1)一些鳞癌患者可能从survivin抑制剂治疗获益:部分肺鳞癌患者p63低表达但survivin蛋白高表达。survivin是一种调节细胞增殖和细胞死亡的蛋白质,是其他类型肿瘤临床试验的靶标。survivin抑制剂也许会让其获益。
2)磷酸化修饰可作为标志物,识别CDK4/6抑制剂治疗获益人群:尽管迄今为止,CDK4/6 抑制在肺鳞癌的药物临床试验中显示出有限的功效,以往人们无法从基因组层面获得更好的解释。但是本文的作者发现, Rb1 磷酸化水平较高的细胞系对 CDK4/6 抑制剂 abemaciclib 和 palbociclib 更敏感。提示Rb1 磷酸化可能成为CDK4/6抑制剂治疗的标志物。
3) “不是治疗靶点“的转录因子SOX2可能要摘下帽子了:在SOX2过表达型的LSCC肿瘤可能对靶向LSD1和EZH2的治疗敏感。这提示着透过蛋白质组学这个镜子,寻找药物靶点会更容易。
对于肺癌患者来说,患有肺鳞癌往往意味着治疗办法少,只有少数人会出现比较好的疗效。在这篇文章中,蛋白质组学促进对重量的理解和治疗。相对于传统的检测手段,长期的用同一个方法,试图找到不同的答案无异于白费功夫。
至少今天你可以做这个动作:关注我们的官方微信,告诉我你的蛋白质组学数据长什么样子,我们一起来探索更多可能。
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