蛋白质糖基化修饰作为最复杂的翻译后修饰之一,不仅增加了蛋白质的多样性,也对其功能发挥起着重要作用。由于糖基化的复杂性,糖蛋白质组学研究是生命组学中极具挑战性的工作之一,其大规模精准解析存在很大挑战。
14点起,两场讲座等着你。欢迎你扫描下图二维码预约今日会议:
第一场:我们有幸邀请到来自复旦大学生物医学研究院的曹纬倩副研究员亲临直播间,与你一起聊聊位点特异性糖基化蛋白质组解析策略及应用研究。
第一场讲座
14:00 - 16:35 | 位点特异性糖基化蛋白质组解析策略及应用研究
在这场报告中,你会有这些收获:
从2017年以来,曹纬倩老师团队聚焦位点特异性糖蛋白质组学技术开发,从糖基化蛋白质组样品前处理、质谱鉴定和数据分析三个层面着手,通过干、湿实验结合的思路,发展了用于位点特异性糖基化蛋白质组研究的新方法;突破了位点特异性糖基化蛋白质组高通量精准解析的技术瓶颈,为进一步深入研究临床样本、生物样本中高度复杂的蛋白质糖基化修饰提供了高效分析策略。
那么你又会问了。蛋白质糖基化修饰,有没有好用的工具?
第二场讲座
16:40 - 17:20 | 完整糖肽分析平台:GlycAP介绍
刘和斌 |上海易算生物科技有限公司|生物信息工程师
具有五年以上蛋白质组学流程分析经验
擅长数据可视化,机器学习,大数据分析
参与deepDIA、 deepPRM 、GlycAP、 Easydia、DeeP 工具研发设计
接下来的第二场, 由易算生物给您带来完整糖肽分析平台—GlycAP。界面如下:
平台目前包含主要的四个分析模块:定性分析,定量分析,功能分析和临床分析,另外还有完整糖肽质谱解析软件的推荐,糖基化蛋白质组相关的数据库链接,平台链接以及网站使用中的常见问题与解答;每个模块由各类分析方法组成,其中定性分析包含基础的糖肽数量统计,motif分析,糖型分析与top20糖型数量的统计,每个糖位点的糖链数量统计以及每个糖蛋白的糖位点数量统计,与Uniprot的匹配情况;定量分析包含了PCA,OPLSDA的分类分析,糖肽的热图聚类,以及差异的糖肽分析;功能分析上我们有MF,CC和BP的GO富集,KEGG富集以及PPI蛋白网络互作的分析;临床分析中我们有对所有糖肽的ROC临床诊断标志物分析以及生存曲线分析等。
敲黑板:这个分析平台由曹纬倩老师团队与易算共同开发完成。在第二场报告中,您将看到这个平台的功能、使用方法、能够接收的数据类型、产出的图表的具体过程。
欢迎你带着自己的问题来参加这两场报告。欢迎你带着朋友来直播间,一起讨论!
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