做完各种蛋白组定量实验后我们不得不面对的一个残酷的问题就是如何进行验证,抛开现在还有一部分人认为质谱作为验证工具不可靠这种抬杠问题不算,如何进行快速有效的靶向验证实验则是一项费心费力的大工程。想要降低工作量和工作难度?了解下我们最新的软件和解决方案吧。


靶向定量分析软件Spectrodive 9 新功能


新一代SpectroDive软件内置Pulsar搜索引擎,兼容Maxquant.live,是您分析靶向数据的不二之选

特色功能优势
全自动
分析参数无需调整,结果可立即用于发表
高通量
轻松处理成百上千个样品,无需人工复核
优化时序
通过iRT高精度保留时间矫正,可以让您同时靶向更多的肽段
支持Pulsar
整合Pulsar算法,直接在Spectrodive内进行搜库、建Panel
个性化Panel构建
向导式的个性化Panel构建,轻松易得
PQ500无缝支持PQ500血液绝对定量试剂盒
改进用户体验
分析向导、结果可视化、差异定量分析等重要步骤都进行了用户体验改进
一站式分析从Panel构建到结果解读全部在Spectrodive中一次搞定

其他改进还包括:

  • PRM实验支持MS1信息,以提高谱峰提取的准确性;

  • Maxquant.live方法采集地靶向定量数据分析;

  • 提高肽段FDR分析准确性,尤其是大规模Panel;

  • 目前我们支持的仪器包括:


来自Mann组的Florian Meier博士的商业互吹。

SpectroDive 9界面


Panel 构建

在Pulsar算法的帮助下,搜库、构建panel轻松简单,可以直接分析DDA, DIA 和含MS1信息的PRM数据

分析面板

 在高精度iRT肽段及矫正算法的帮助下可以增加同时检测离子数量,并使得PQ500试剂盒更有效的用于PRM实验。

Panel准备面板

跟随向导一步步简单操作即能得到最佳panel

结果分析

稳健的谱峰提取算法可以无需人工检查即可报告准确定量结果。无论是单个样品还是整个实验的定量结果均可轻松展示。

后处理


和Spectronaut一样,后处理面板可以分析查看项目整体情况,并进行差异统计和整体结果可视化。


PQ500试剂盒

PQ500人血蛋白绝对定量试剂盒包含来自于580个蛋白的近800条同位素标肽及其用于DIA,PRM分析的相关数据库。可以快速帮助您进行血液蛋白绝对定量及长时间蛋白量变跟踪研究。

作为一种典型应用场景,血液Biomarker筛选的研究在应用PQ500试剂盒后变得如此轻松简单。只需要在常规DIA/PRM实验中掺入PQ500标肽即可对数百种血液常见蛋白、FDA认可的常见标志物进行绝对定量。

PQ500试剂盒中的蛋白丰度跨度从高丰度到中低丰度,均为常见可检出蛋白及已知各类癌症标记物蛋白,联系易算可获取相关蛋白注释及biomarker信息。

而利用DIA研究的独特优点,同时对PQ500 panel中的蛋白和非panel蛋白进行绝对和相对定量,可最大化的利用单次质谱检测中的所有信息。

最终一次实验即可得到高精度的血液蛋白绝对、相对定量信息。



参考文献

本篇文章参考了许多相关文献,在这里就不一一叙述,如果您想了解或者下载其相关参考文献,可以和易算联系,我们提供整套方案或者培训课程。


Omicsolution

    Omicsolution致力于蛋白质组学新技术、新方法在中国的推广和实践。我们团队成员拥有超过10年的蛋白质组学信息技术、仪器技术和实验技术经验。与加拿大BSI公司、瑞士Biognosys公司、以及赛默飞世尔国内蛋白质组学团队紧密合作,为国内蛋白质组学实验室快速吸收、发展国际先进软硬件技术保驾护航。

    我们的团队成员来自于复旦大学生物医学研究院蛋白质组学中心,从2005年起就从事蛋白质组学及信息学研究,我们的技术团队经验丰富、创新进取,紧跟学术界最新发展。

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