把你的显卡加速启用后,分析大队列DIA数据您可能依然会觉得不够快,那是因为spectronaut在检索的时候还是一个个数据排着队检索,那么必然导致在部分计算步骤中算力浪费。所以在Spectronaut19发布后,BGS为大家推出了并发版本,通过1. 基于云/集群(全新集群license)进行高并发检索提升检索速度,如下图,可以提速5-10倍(取决于队列大小)。当然该方案不是非得基于AWS,其他云服务器或本地集群亦可。如有需求请直接联系我司技术支持或和您对接的销售。2. 本地floating license(2-5)并发计算,基于Spectronaut命令行版本,我司专门为用户编写了OmicsCloud平台支持并发本地多计算机计算,计算流程其实和云或集群版本类似。OmicsCloud帮您将大队列样品分发到本地局域网内的多台spectronaut计算服务器(windows和linux均可),分别进行directDIA+机器学习及计算(如果每台子节点电脑都有CUDA加速则更理想了),然后再汇总到主节点服务器进行search archive也就是psar结果整合,再进行整体DIA Analysis(该步骤就非常快了)。如有需求请直接联系我司技术支持或和您对接的销售。3. 如果您暂时软硬件条件不足,请放心,我们依然给您提供单机提速方案a. 软件内添加好directDIA搜库参数,fasta文件(基操)b. 将需要分析的数据(不一定需要全部采集完,采集了多少就可以分析多少)放到特定目录下c. 打开spectronaut Pipeline视图,选择Job monitor标签,右下角选择set up job monitoring pipeline,在弹出的设置窗口选择 name(项目名称,不重要),Path(数据文件路径,即步骤b中的目录),output folder(结果输出目录),schemas面板选择步骤a中设好的参数,最下方fasta files面板选择步骤a中设好的fasta库。点击confirm即完成设定。如无意外,spectronaut即自动开始对每个样品进行检索了。说对了!你可以多新建几个目录啊,只要当前计算机够nb,你可以开3个,4个,5个甚至更多个数据平行存储目录,然后同时打开这么多个spectronaut 进程并进行pipeline分析。这样每个DIA文件都会得到一个分析结果目录,每个目录里都有一个psar文件,记得回头通过everything或者任何系统里的搜索功能将他们汇总到一起。d. 完成以上分布式(伪)分析后,回到spectronaut library(久违的)面板,点击generate library from Pulsar/search archive,出下如下界面后,直接点击next然后点击from file后把刚才的psar文件们全部导入,合并成单一数据库kit即可。如果你也做了分级建库,记得再单独生成一个kit哦e. 正式分析,后面就都一样啦。按照常规的spectral library检索方式操作即可,本文就不啰嗦啦。服务热线:17863958584(销售),18221381405(技术支持)邮 箱:sales@omicsolution.com