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    现在质谱速度越来越快,样品处理也都高通量自动化了,而搜库速度在质谱数据越来越大,越来越复杂的时候好像“变得”越来越慢了?
    当前两年机器学习引入Spectronaut后就一直有人问我GPU加速机器学习啥时候搞定?不过快点的也还是要代价的,您准备好一张支持nVIDIA CUDA加速的显卡,然后教您怎么加速就是我的责任了。
操作系统:windows 10,11,server2019,2022;
显卡:英伟达,支持CUDA,常见如4060,4070,4080,4090均可
第一步

下载CUDA, cuDNN包,请文末点击阅读全文获取下载链接

第二步

安装:CUDA直接一路默认参数安装即可,cuDNN解压缩到C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\cuDNN 目录下

第三步

设定环境变量,开始菜单搜索

设置环境变量:

新建如下path:

C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\cuDNN\bin

C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\cuDNN\include

C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\cuDNN\lib

C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\12.2\bin

C:\Program Files\NVIDIA GPU Computing Toolkit\CUDA\12.2\lib

第四步

打开Spectronaut,选中GPU加速

第五步

重启电脑

第六步

提交一套分析看看效果呗:比如用仅仅16核CPU的普通台式机,处理24分钟梯度Astral,9个样品,共耗时1.87小时。