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title: "悟空云2020年12月更新日志，元旦不要忘记学习"
author: "omicsolution"
account: "omicsolution"
published_at: "2021-01-01T10:20:54+08:00"
captured_at: "2026-08-26T17:50:43.762416+08:00"
source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s/btBCjrnXjsIZXcKEj9OwHg"
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# 悟空云2020年12月更新日志，元旦不要忘记学习
新年快乐呀，趁着元旦假期，好好学习吧

1.新增画峰度范围排序图模块（该模块主要用来展示定量到的蛋白质、代谢物或者基因等的定量范围，也是文章中常见的展示图形之一）：

![图片 1](images/001.png)

2.新增多个独立实验得到的P值组合校正分析模块（有些时候，我们会通过多种方法或者多个实验得到不同的P值，这时候，我们想整体对其进行评价，得到一个总体的P值，这时候就可以用这个方法来试试。）：

![图片 2](images/002.png)

3.新增差异相关性分析模块（此模块使用稍微复杂一丢丢，主要是DGCA和MEGENA模型的组合使用，其通过计算各个对象（蛋白质、基因或者代谢物等）的在不同组样本中的相关性，然后计算统计差异，从相关性层面找到有统计学差异的蛋白质、基因或者代谢物对，然后再利用MEGENA模型寻找核心模块及对应的核心基因，并画出相应的网路图。使用时用户需要多加细心。参考文章：doi: 10.1186/s12918-016-0349-1, doi: 10.1371/journal.pcbi.1004574。）：

![图片 3](images/003.png)

4.优化变异系数计算模块（优化画CV分布图时，填写多个阈值时的错误）：

![图片 4](images/004.png)

5.优化数据个性化处理模块（优化求1组数据时结果显示的问题）：

![图片 5](images/005.png)

6.优化数据标准化模块（优化当列数太多时报错的问题，因为不少用户有这种需求，比如将原来传统的表格数据转置以后，即这时候行是样本，蛋白质是列，由于蛋白质往往较多，因此列就会变得很多，这时候加载就容易出问题）：

![图片 6](images/006.png)

7.优化GO富集分析2模块（经多位用户反映，由于有的GO名字过长，因此在分类bar图中以前多用省略号显示，现在增加一个参数，用户可以调节此参数对相关的名字长度进行控制显示。）

![图片 7](images/007.png)

目前基于悟空平台开发的分析工具已发表以下文章：

NAguideR模块：

(2020) Shisheng Wang , Wenxue Li, Liqiang Hu, Jingqiu Cheng, Hao Yang, Yansheng Liu, NAguideR: performing and prioritizing missing value imputations for consistent bottom-up proteomic analyses, Nucleic Acids Research, gkaa498. (IF: 11).

motifeR模块：

(2019) Shisheng Wang , Yue Cai, Jingqiu Cheng, Wenxue Li, Yansheng Liu and Hao Yang. motifeR: An Integrated Web Software for Identification and Visualization of Protein Post‐Translational Modification Motifs. Proteomics: 201900245. (IF: 3).

pseudoQC模块：

(2019) Shisheng Wang and Hao Yang. pseudoQC: A Regression‐Based Simulation Software for Correction and Normalization of Complex Metabolomics and Proteomics Datasets. Proteomics: 1900264. (IF: 3).

MetaboGroupS模块：

(2018) Shisheng Wang , ..., and Meng Gong. MetaboGroupS: A Group Entropy-Based Web Platform for Evaluating Normalization Methods in Blood Metabolomics Data from Maintenance Hemodialysis Patients. Anal Chem 90, 11124-11130. (IF: 6).

MixProTool模块：

(2018) Shisheng Wang , ..., and Hao Yang. MixProTool: A Powerful and Comprehensive Web Tool for Analyzing and Visualizing Multigroup Proteomics Data. Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology 25, 1123-1127. (IF: 1).

![图片 8](images/008.png)

同时悟空平台整合上百个分析模块，包括且远不止以下功能

![图片 9](images/009.png)

而围绕上游质谱数据解析和下游组学应用，易算近期也发表了多篇文章：

(2020)Yi Yang, ..., and Liang Qiao In silico spectral libraries by deep learning facilitate data-independent acquisition proteomics. Nature Communications

https://doi.org/10.1038/s41467-019-13866-z (IF:13)

(2020）Shuping Long, ..., Liang Qiao Metaproteomics characterizes human gut microbiome function in colorectal cancer. npj Biofilms and Microbiomes

https://doi.org/10.1038/s41522-020-0123-4 (IF: 18)

(2020) Rutan Zhang, ..., Liang Qiao Proteomic and Metabolic Elucidation of Solar-Powered Biomanufacturing by Bio-Abiotic Hybrid System.

https://doi.org/10.1016/j.chempr.2019.11.002 (IF:5)

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