--- title: "我们的年终总结和展望" author: "沈诚频" account: "沈诚频" published_at: "2024-01-01T20:42:19+08:00" captured_at: "2026-08-26T17:31:12.408479+08:00" source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s/GfAf3mOGZrQNWjmP-tIRDA" --- # 我们的年终总结和展望 ![图片 1](images/001.gif) 点击蓝字，关注我们 ![图片 2](images/002.png) 来自Dall-E的外星文字合成 在2023年，易算生物致力于使蛋白质组学更加普及和高效。尽管在研究出版和产品开发方面遇到了挑战，但公司还是实现了重要的合作并在蛋白质样品准备和自动化方面取得了进展。他们将创新进行到底，在2024年计划推出新产品，旨在完善客户体验，为蛋白质组学领域做出重大贡献。 以上是来自chatgpt的偷工减料的年终总结 以下为正文 去年注定是不平凡的一年，不但是因为疫情解封后的第一年，也是所有人都在感慨生活竟如此不易的一年。名字中带着“易”的我们也好不容易过完了这一年。在此也做个小小的总结和2024年的展望，每段内容都总结我们的不足和成绩，与诸位共勉。 科研合作 ![图片 3](images/003.png) 我们的不足 由于人手不足（过于拖沓），我们的相关研究一直未能有效成文，相似结果发表在了Nature Methods上，实在痛心。而同时我们已发的方法学文章提供给客户端的转化应用进度也较为拖沓，今年一直PPT里吹的4天内完成一套队列质谱分析的口号也还是遇到一些挫折。为了让用户们不再等待，我们不停地督促自己提高效率，不断改进，让用户们尽快体会到蛋白质组学高效研发的真正速度。 我们的成绩 23年，易算成员参与并在Nature Commun，Anal Chem，Proteomics，PNAS等高水平杂志上发表多篇研究论文。为蛋白质组学的发展做了一点小小的贡献。 - DeepFLR facilitates false localization rate control in phosphoproteomics ![图片 4](images/004.gif) Nature Communications, 2023 - An optogenetic-phosphoproteomic study reveals dynamic Akt1 signaling profiles in endothelial cells Nature Communications, 2023 - Pick-up single-cell proteomic analysis for quantifying up to 3000 proteins in a tumor cell Nature Communications, Just received - Data-independent acquisition boosts quantitative metaproteomics for deep characterization of gut microbiota npj Biofilms and Microbiomes, 2023 - Quantitative metaproteomics reveals composition and metabolism characteristics of microbial communities in Chinese liquor fermentation starters Frontiers in Microbiology, 2023 - Rapid and High-Sensitive Phosphoproteomics Elucidated the Spatial Dynamics of the Mouse Brain Analytical Chemistry, 2023 - Proteome and phosphoproteome profiling of non-small cell lung cancer cell line A549 treated with TRAIL Proteomics, 2023 - Molecular responses during bacterial filamentation reveal inhibition methods of drug-resistant bacteria Proceedings of the National Sciences, 2023 推广与合作 我们在23年重启了中断3年的各项市场合作和推广活动 我们的不足 我们和多家上下游龙头企业实现了广泛的产品、应用及培训售后的合作，不过进度和成效尚不能令人满意，出现了临时抱佛脚出方案、售后不及时和测试安排不周等问题，我们立志来年安排更多的技术专家与甲方爸爸们深度合作，提高产品满意度，让广大与我司合作的仪器、试剂、医药、科服、研发等企业没有后顾之忧。 我们的成绩 我们参与了多场全国性质谱、蛋白质组学会议，包括质谱年会、CNHUPO等，并和布鲁克等公司联合举办了多场用户培训会议。向本领域内的专家学者们充分介绍了我们的产品、我们的想法和合作的前景。目前我们已和多个蛋白质组实验室达成了更深度合作的意向，会在今年适时向诸位汇报。 蛋白质组样品制备 我们的不足 我们的PreOmics及易肽系列试剂盒，以及BeatBox，PreON，AUTO100，Frac，GelD等自动化产品受到了用户们的认可和广泛使用，但使用过程中客户对产品价格、使用成本、交付速度、产品可靠性、硬件结构设计优化、售后培训、易用性等诸方面提出了更高的要求。其中相当一部分问题是我们的技术团队在产品推出前欠考虑导致的，在用户反馈意见后才进一步的改进、迭代，这其实是加重了用户的使用成本。对此我们进行了深刻的反思，必须在产品推出前更深入的思考客户需求，完善产品功能，我们也在此向广大用户保证，任何向我们提出的意见和建议，我们必将第一时间进行反馈和改进，并优先为积极提供修改意见的用户提供新产品测试。我们致力于在24年让客户用到更加完美的产品，将更多的交流时间放到产品迭代、用户体验提升上去。 我们的成绩 23年是易算前处理产品线异常繁忙和收获满满的一年，我们摆脱疫情的束缚，全力开工，陆续发布了： - 易肽AUTO100高通量全自动化蛋白质组前处理工作站 - 易肽Frac极微量多肽分级工作站 - 易肽GelD凝胶电泳自动化处理工作站 - 易肽Ultra单细胞前处理试剂盒 - 易肽tip C18脱盐试剂盒 - 易肽FFPE极微量石蜡切片蛋白质前处理试剂盒 我们也将继续不断奋进，在24年初陆续发布一系列创新性产品。包括且不限于： - 易肽Glyco糖基化蛋白富集及前处理自动化流程及试剂盒 - 易肽万磁王蛋白质富集及前处理自动化工作站 - 易肽EasyColumn无与伦比的自填柱体验，敬请期待 我们的新产品一经推出，迅速获得了广大用户的好评和采购。目前我们的前沿产品如易肽AUTO100系列自动化工作站、易肽DeeP低丰度蛋白富集试剂盒已经广泛受到头部蛋白质组科服公司和高校实验室的认可，整个市场占有率直逼100%！这份认可也让我们辛勤工作的工程师们非常振奋，在此我也特别向这一年辛勤工作的同事们致以敬意。24年我们誓将我们秉持的“易”和“算”贯彻到底，基于真实可靠的数据和用户的真实体验，自下而上的推动整个蛋白质组分析流水线的进化，推动蛋白质组学的普及和发展。 ![图片 5](images/005.png) EasyPept AUTO100迅速受到广大用户欢迎 色谱配套产品 我们的不足 23年一系列新品质谱的推出大大推动了蛋白质组学技术发展，而我司财力有限无法快速跟进而导致配套的色谱分析方法落后于其他产品进度，随着24年新质谱陆续到位，我们将快速跟进新方法、新技术的发展，为客户优化、设计最优化的色谱柱规格、分离方法。 我们的成绩 Aurora系列高性能色谱柱广受用户好评，我们的用户结合易肽试剂盒+Aurora最新TS系列色谱柱，实现了连续使用7个月而保持非常低性能损失的记录，最后替换下来的时候柱压也没有超过600bar。这个记录让我们备受振奋，也让我们对基于纳升流速的大队列蛋白质组方法的可靠性有了充分的信心。而我们自己也实测了极高通量血液蛋白质组的数据，在老一代质谱上实现的100spd，平均3000+的定量深度也让我们对新老质谱都能够实现临床大队列的深度检测充满了信心。 Spectronaut系列软件 我们的不足 Spectronaut系列软件在今年实现了最新机器学习算法更新和Linux支持，海量的新实验数据和最新的hybrid方法让我们疲于应对，相应的技术文档和测试数据跟进实在太慢，一直到年底才陆续更新了相关内容，由于相关技术同事有着太多的自动化工作站测试任务，软件应用文档的更新备受用户诟病，在24年人手不足的危机逐步缓解后，我们确保所有新老产品的技术资料迭代一定让您满意。 我们的成绩 今年我们交付了数十套Spectronaut软件及配套高性能服务器，为大江南北的海量用户普及了DIA分析的思路和日常操作流程。Spectronaut软件中国用户的发文数量飙升，24年我们将继续围绕DIA蛋白质组学如何更好地为科研服务而殚精竭虑。 ![图片 6](images/006.png) 悟空云 我们的不足 悟空云是易算生物成立以来一直坚持不懈维护和升级的生信产品，并且坚持8年没有收费，广受广大科研工作者的好评。不过总的来说，悟空云分析的成果转化率偏低，虽然我们的用户已有数千个，但每年引用发文并没有很大的增长，表明大量的用户使用我们平台后没有有效转化为科研成果。其原因一方面是易用性、美观性达不到很多用户的要求，另一方面也是因为悟空云本身缺乏有影响的文章支持。这是主观上的不努力，客观上的品味落伍导致的。在此立下flag，24年上半年我们的网站，我们的界面，我们的图一定洗心革面，焕然一新。而悟空云本身作为一个生信工具，我们争取把给您引用的支持论文发表出来。如若再跳票，就把王工祭旗。 我们的成绩 版本更新 截止去年底，悟空云更新到了第42版，模块总量达到了233个。录制的讲解视频达到了40集。 ![图片 7](images/007.png) 新增用户 本年度新增注册用户3792位。国内使用情况如下图，可以看出主要集中在北京、广东、上海、四川、江苏，这大体可以反映做蛋白质组学、代谢组学比较集中的省市。 ![图片 8](images/008.png) 发表文章情况 通过Google Scholar查阅，本年度一共找到67条包含wkomics的记录。其中多篇发表在Advanced Materials、Nature Communications、MCP、Food Chemistry等国际知名期刊上。 GlycAP/easyDIA 我们的不足 GlycAP是易算和复旦大学曹纬倩研究员合作创建的糖基化分析平台，easyDIA是易算构建的为Spectronaut用户进行质控的分析平台。推出1年来，我们一直要改进的界面风格、使用方式统一化和后台数据库同步因算法工程师的跳票而将拖到24年，今年我们将立志和悟空云同步更新，做不到的话也准备把刘工和陈工给祭旗了。 我们的成绩 在我们推出这些分析平台后，我们坚持更新并响应用户诉求，将用户所需要的功能性、易用性诉求尽可能的快速满足。通过多轮功能迭代，用户在使用了pglyco，pglycoQuant后，可以轻松地在glycAP上进行各类下游分析，目前已有近千次分析。而EasyDIA也已经逐步整合自动化搜库、质控、生信功能（未完工，待将工程师祭旗），希望我们的分析工具能在24年得到更多用户的认可。 定制化高级生信 我们的不足 本领域是如此之卷，而甲方爸爸们的需求是如此之多是我们始料未及也是能力不足的地方。造成了多个项目的修回和进度拖延我们在此向甲方爸爸们诚挚的道歉，当然我们的风格不是鞠了躬就完事的，我们近期也大大加强了相关生信力量，生信团队也秉持着997的理念加班加点的进行方案迭代及完善。希望来年给用户们带来全新的体验。 我们的成绩 在我们的协助和参与下我们发表了多篇高水平的论文（见首段），同时也将多篇发表的论文进行了流程化、可视化的转换，即将在24年向我们用户全面推出，大大降低蛋白质组学生信高级分析的难度和成本，敬请期待。 最后祝各位 新年变得更强 HAPPY NEW YEAR 相关链接： - 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