在质谱样品制备过程中，有一类比较特殊的样品就是胶条，它的前处理工作流程复杂，步骤多，工作效率低，而且处理过程中还极易受到实验人员的角蛋白污染。
然而，考虑到一些特殊的实验目的，小伙伴们又不得不选择胶条样品，进而对关注的目标条带进行质谱鉴定，比如Co-IP样本跑胶后的差异条带。
那怎么办呢？为解决胶条蛋白前处理的上述难题，易算生物将于2023年CNHUPO大会隆重推出易肽GelD全自动胶条蛋白前处理工作站，此工作站是为SDS-PAGE胶（包括native胶）上切取胶块的蛋白前处理而设计，实现胶粒的脱色、清洗、干燥、还原烷基化等自动化流程。以下将具体介绍该工作站的特性，以及与手动流程的测试比较。
与传统手动流程相比，该自动化工作站流程大大缩减了人工时间，2-3天的工作量可以一晚上轻松搞定，而且运行后不需要手工介入。
一、易肽GelD系统特性
1. 易肽GelD系统构成
（左）抽吸试剂所用注射泵及载架
（右）借助自动化机械臂在不同样品管间添加/吸弃试剂，吹打胶条
2. 全自动化操作、高通量处理
a. 不同样品管间自动加液
b. 反复多次自动吸弃废液
解放双手，节约手动时间，自动化加液、吸液操作，避免交叉污染，避免操作误差。
最多同时处理96个胶条，一晚上轻松搞定，提高工作效率。
3. 封闭操作环境
全封闭的操作环境，有效避免角蛋白等对样品造成污染。
4. 智能网络功能
软件界面流程化，支持定制化的反应程序设定。
支持远程控制及监控，随时随地了解及控制实验进程。
二、易肽GelD系统测试效果
使用IPMS样本，平行跑4块胶，一块胶条样本通过手工流程进行胶条蛋白前处理，另外3块胶条样本通过GelD自动化胶条蛋白前处理，后续进行质谱检测，以下对蛋白鉴定结果进行比较。
1. 降低角蛋白污染
TIC图中不难发现，手动流程（RENGONG，浅绿）相比三个自动化流程（AUTO）多了很多杂峰，推测是角蛋白污染。
质谱鉴定结果，纵坐标是峰强度的对数转换，横坐标为鉴定到的蛋白，图中显示手动流程（manual，蓝色）比自动化工作流程（auto）的角蛋白（keratin）峰强度高了至少一个数量级，印证了上述TIC结果。自动化处理中引入的角蛋白则只可能是来自跑胶步骤了。
2. 可靠性
上图展示了GelD流程的目标蛋白质序列覆盖率达到96%，和高水平手工处理结果相当。而覆盖率越高，说明提取效果越理想，污染越少，对目标蛋白质的鉴定和定量也越准确。
3. 系统稳定性
上图显示3个GelD平行处理的结果PCA图很好的聚集在一起，说明系统稳定性良好，并且与手动流程明显区分开，可以有效减少手动操作误差。
适用样本
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