涉及的直播:【周五直播】| 基于质谱的菌群分析、宏蛋白质组及DIA机器学习技术 | 应用研讨会
2022年8月26日,即8月最后一个周五,易算生物直播间为大家带来了两场讲座。如果您错过了这期直播也不要着急,我们为您精剪了回放视频,帮你了解最新的研究动态。
1、第一场讲座

1.0、分享大纲
DIA(data independent acquisition,数据非依赖性采集)技术发展已近十年,得到广泛应用也有5年左右时间。更具性能优势的DIA定量方法替代传统的LFQ和TMT/iTRAQ标记定量一直受到业界关注。
DIA的优点有哪些?足够准、足够快、足够深。 然而,DIA技术发展早期给人带来的固有印象便是实验繁琐,需要建库,数据解读复杂等问题,这也限制了该技术的应用。但是近五年,随着质谱性能的提升和机器学习算法的引入,DIA技术实现了飞跃式发展,成为了质谱定量的主流方法。
本讲座为大家介绍了DIA技术原理,以及几种定量方法的对比。并且,全面介绍了最新的Spectronaut16进行DIA定量的全新流程和优异效果。希望可以为您的实验室技术升级消除障碍。
划重点:单纯修改质谱参数,能不能直接实现足够准、足够快、足够深?有前提。整个实验环节一环套一环,好比木桶原理,最大功率由最薄弱的那一环决定。因此你需要关注整个实验里面,可能会遇到哪些坎,而可能的解决路径又有哪些,这些会在讲座中普及。
1.1、DIA为质谱蛋白质组带来哪些提升
1.2、Spectronaut16算法与传统工具的对比,以及DIA实验要注意的问题
你也许也关注这些问题:
如果我实验室也选了DIA技术,但是我只鉴定到了几百个蛋白,但是我看到文章里面都是一千多,那我问题可能出在哪里?
如果用户给了您从来没有处理过的材料,而且很珍贵,您怎么保证他的DIA数据好?
如果用户只能一批一批的给你材料,比如说病人的新鲜样本。您打算来一批就上机一批,还是说为了避免批次效应,攒够了再开始实验?能不能举几个例子?
在DIA这个领域,您都听过哪些糟糕的建议?
……



嘉宾信息

最后, 感谢复旦大学化学系乔亮研究员、易算生物CEO沈诚频博士,抽出百忙时间,做的精彩分享! 感谢大家对本次直播话题的关注!
乔亮老师的分享见直播回放(下)
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