涉及的直播:8月31号直播 | 4D-蛋白质组技术研讨及SpectroDive11更新介绍
近年来随着离子淌度分离技术(TIMS)以及机器学习算法的引入,蛋白质组学朝着更深、更快、更准的方向有了飞跃式发展。相较于传统3D-蛋白质组学技术,4D-蛋白质组技术能够进一步基于离子的可重复测量的碰撞截面积值(CCS)进行更多一维度的分离,由布鲁克公司推出的TimsTOF质谱同时结合PASEF(Parallel Accumulation Serial Fragmentation,同步累积连续碎裂)技术,实现了检测深度、灵敏度、准确性以及通量的全面提升。
那么什么是CCS?什么是离子淌度技术?PASEF技术又有哪些优势?TIMS+PASEF又是怎样强强联合在微量、大队列、翻译后修饰等珍稀样本的蛋白质组检测中得到广泛应用的?第一部分的视频回顾可以为您答疑解惑:
原理我们了解了,如何落地实现才是我们最为关注的问题。方法如何编辑?方法编辑的关键原则有哪些?目前有哪些新的技术方法可以或者将要为我们所用?带着这些问题进入我们直播的第二部分:
数据拿到了,数据质量如何?怎样提取关键的谱图信息?第三部分,我们一起基于Compass DataAnalysis软件查看原始数据:
其中,prm-PASEF技术相较于传统PRM技术,因为有了更多一维度的分离,可以更高效的排除干扰离子,同时由于PASEF技术的加持离子利用率更高,扫描速度更快,在相同的梯度下可监测更多的目标离子。这也同时意味着我们数据分析的工作量增加了数倍,而SpectoDive 11的发布无疑是场及时雨,SD 11全面支持离子淌度数据的分析流程(包括FAIMS-PRM和prm-PASEF),支持绝对定量分析流程。在接下来的视频中您可以跟随我们一起亲身体验SD 11带给我们的靶向数据分析的高效和便捷:
最后感谢布鲁克·道尔顿公司蛋白质组学应用主管杜潇贤带来的专业、全面的分享,感谢大家对于本次直播话题的关注。
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