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title: "重磅更新！Spectronaut™ 10上线！"
author: "Tatsu"
account: "Tatsu"
published_at: "2016-12-08T00:08:00+08:00"
captured_at: "2026-08-24T11:50:19.055972+08:00"
source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MTI5NDAzNg==&mid=100000061&idx=1&sn=38c141c718aef2660d0c2b3a62e23126&chksm=6a5dd3865d2a5a90bd716cbfeeb396550753a4530823108f3b43a24eb034fdf0ae0f9b02d69b#rd"
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# 重磅更新！Spectronaut™ 10上线！
前言

Omicsolution携手DIA/SWATH数据分析专家Biognosys带来了Spectronaut™的最新版本Spectronaut™ 10，该版本针对应用DIA技术的发现式蛋白质组研究进行了优化，推出了性能更好的定量算法及其他蛋白质组相关功能，于此同时保持了Spectronaut™软件一如既往的便利性。

点击下方原文链接访问Spectronaut™产品页面，可观看软件介绍视频及最新视频教程

软件介绍

![图片 1](images/001.jpg)

Spectronaut™软件是为了分析HRM-MS™ (DIA或SWATH™数据)特别开发的。HRM，超反应监测，是Biognosy公司基于DIA技术（data independent acquisition）开发的下一代蛋白质组学技术，使用这项技术可以在一次实验中实现1000种以上蛋白质的高重复性及准确定量。Spectronaut™与iRT试剂盒或HRM校正试剂盒配合使用可以实现DIA或SWATH™数据的信号全自动、快速、准确处理。

重要提示：自Spectronaut™ 10发布开始，Spectronaut软件开始收费，老用户将可以获得1年的免费升级服务，详情欢迎来电或邮件咨询。

关键更新

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改进了定量逻辑(Quant 2.0)；

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应用了新的蛋白定量算法(Protein Quant 2.0)；

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谱图库生成功能的高级优化；

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Spectronaut™中建立的谱图库与SpectroDive™实现无缝衔接；

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改进了RAW文件读取模块，加快了读取速度；

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增加了GO注释功能。

Spectronaut™与超反应监测

超反应监测Hyper Reaction Monitoring (HRM-MS™)是Biognosys专利的基于DIA技术（非数据依赖采集，类似SWATH™）靶向分析的非标记发现式蛋白质组实验流程。HRM Workflow能够在一次DIA实验中（DIA, SWATH）以无可比拟的蛋白质组覆盖率定量多达9000种蛋白质。配合使用Spectronaut™，HRM Workflow最适合用于鉴定差异表达蛋白或在蛋白质组层面进行高通量蛋白定量。

近期一篇Nature Biotechnology文献1对DIA相关软件进行了比较，标题为 “A multicenter study benchmarks software tools for label-free proteome quantification”，这篇文章开发了一款可以用来平行对比不同DIA软件效能的工具，如定性能力、自动化能力和各方面定量的正确性。结果显示Spectronaut 软件表现出色，在多次平行实验间实现了非常低CV和高灵敏度。(更多关于此文章内容请参考Omicsolution首页新闻。)

Biognosys此后持续进行着Spectronaut™的开发，并于2016年11月30日发布了最新的Spectronaut™ 10，并运用上述文章中的工具，对软件的性能优化进行了论证。

从下表可以看到，Spectronaut™ 10与Spectronaut™ 7相比，CVs低于20%的肽段定性及定量数量得到了显著提高。

![图片 2](images/002.jpg)

在蛋白质水平同样观察到了相同的趋势，通过Spectronaut™ 10内置的全新定量算法（Protein Quant 2.0），CVs低于20%的蛋白质定性及定量数量比Spectronaut™ 7提高了40%。更重要的是，这些优化并没有造成数据完整性的丢失。而与Spectronaut™一贯表现一样，使用默认设置就可以得到最佳性能，避免了冗长复杂的参数设置。

Spectronaut™ 10对所有主要功能界面进行了扩展及修改。在准备界面增加了更多生成谱图数据库的选项，使得用户可以轻松地建立数据库并导出用于SpectroDive™的PRM及MRM测量。

对于DIA数据分析，Spectronaut™ 10使用了新数据导入算法，当使用Sciex数据时，可以大致观察到分析时间快了将近四倍（分析6个wiff文件的时间为41min对150min）

![图片 3](images/003.jpg)

参考文献：
1. Navarro, P. et al. A multicenter study benchmarks software tools for label-free proteome quantification. Nat. Biotechnol. (2016). doi:10.1038/nbt.3685
2. Bruderer, R. et al. Extending the limits of quantitative proteome profiling with data-independent acquisition and application to acetaminophen-treated three-dimensional liver microtissues. Mol. Cell. Proteomics 14, 1400–10 (2015).
3. Bruderer, R., Bernhardt, O. M., Gandhi, T., Gomez-Varela, D. & Reiter, L. Single shot deep DIA methods with optimal coverage, reproducibility and quantification precision. ASMS 2016, San Antonio.

![图片 4](images/004.jpg)

Omicsolution

Omicsolution致力于蛋白质组学新技术、新方法在中国的推广和实践。我们团队成员拥有超过10年的蛋白质组学信息技术、仪器技术和实验技术经验。与赛默飞世尔蛋白质组学团队紧密合作，为国内蛋白质组学实验室快速吸收、发展国际先进软硬件技术保驾护航。

同时我们拥有行业最先进的Thermo Scientific

![图片 5](images/005.jpg)

Q Exactive质谱仪，Orbitrap Fusion Tribrid质谱仪等分析平台，可满足客户的不同需求。

目前我们的团队成员来自于复旦大学蛋白质组学中心、上海交通大学系统生物研究院、中科院上海生命科学研究院等院校机构，从2005年起就从事蛋白质组学及信息学研究，我们的技术团队经验丰富、创新进取，紧跟学术界最新发展。

更多蛋白质组学技术信息请参阅我们的官方网站：
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![图片 6](images/006.jpg)

![图片 7](images/007.jpg)

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