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title: "非特异性检索+DIA+机器学习=20"
author: "scp"
account: "scp"
published_at: "2025-06-04T00:53:14+08:00"
captured_at: "2026-08-26T17:18:28.386392+08:00"
source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s/DwD3h9_63DEe-AUB28eOag"
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# 非特异性检索+DIA+机器学习=20
曾几何时，培训的时候被问起DIA不能做啥，通常我会不假思索的回答：多种修饰搜索，多肽组，库特别大的不建议用DIA。

加速你的大队列DIA分析 进阶版

上个月我已经介绍过Spectronaut19检索宏蛋白数据的优势了，这个是在fasta层面解决的一个痛点。

而multiplex-DIA技术又解决的新生蛋白的定量问题

Cell ！刘延盛/彭隽敏及悟空云作者王诗盛等首次绘制小鼠多器官蛋白质组周转图谱 开创plexDIA技术新篇章

那么剩下的痛点就留到Spectronaut20来解决了：搜库空间大带来的速度和假阳性问题。以及单细胞蛋白质组的狂飙突进带来的定性、定量可靠性的焦虑。

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免疫肽分析速度提速3倍

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directDIA结果相对于老版本的library结果还能提升近50%

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全新PTM Probing检索模式，同时检索数十种修饰和非特异性酶切却不增加检索时间

![图片 3](images/003.jpg)

实测astral 24分钟DIA，hela样品，设为非特异性酶切（unspecific）+30种可变修饰位点检索

![图片 4](images/004.png)

directDIA+检索时间仅需34分钟。

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timsTOF定量引入离子淌度信息提升定量精度

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提升数据质量

- 改进FDR流程，增强蛋白质鉴定的可信度

- 新增全局precursor FDR功能，尤其适用于肽组学研究

- 新增通过分组计算Precursor FDR，提升非典型蛋白质数据库的鉴定置信度

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以及进一步增强命令行功能，让大队列分布式计算更加灵活实用。

![图片 5](images/005.png)

![图片 6](images/006.png)

![图片 7](images/007.png)

随着横亘在DIA普及前的最后几座大山被攻克，你还犹豫什么呢？

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上海易算生物科技有限公司

Shanghai Omicsolution Co., Ltd.

上海易算生物科技有限公司，专注于利用LC-MS/MS和生物信息学技术，为客户提供高质量的研究方案。我们与国内顶尖的蛋白质组实验室紧密合作，开发最新的蛋白质组相关技术和产品。从DIA、PRM分析产品、单细胞及极微量蛋白质前处理，低丰度蛋白深度挖掘，糖蛋白质组，宏蛋白质组整体方案实验室落地方案等，易算均有国际前沿水平并在高分杂志上发表成果的技术产品。我们还引入了国外先进的软件和产品，包括来自瑞士Biognosys公司、德国Bruker公司、德国PreOmics公司和澳大利亚IonOpticks公司等，为国内科研机构提供先进可靠的实验及软件解决方案。

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