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title: "高通量蛋白质组，到底能有多高通量"
author: "omicsolution"
account: "omicsolution"
published_at: "2021-10-12T15:08:31+08:00"
captured_at: "2026-08-24T11:50:16.020439+08:00"
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# 高通量蛋白质组，到底能有多高通量
![图片 1](images/001.png)

在鱼与熊掌尚不可兼得的时代，如果我们牺牲一部分灵敏度，能够实现多高通量的定量蛋白质组学检测呢？今天让我们看看最新示例：一天做180个样品！

样品类型：Hela细胞|人血

色谱柱：IonOpticks 5cm 快速分离喷针一体色谱柱

![图片 2](images/002.png)

色谱梯度：U3000/M-Class 7.5分钟分离

![图片 3](images/003.png)

质谱：Bruker Tims Tof Pro

检测通量：180个样品/天

Hela 定量结果

简单总结：平均每针定量检测到3600个蛋白质，16000个多肽，保留时间、定量相关性均非常稳定。

肽段水平：

![图片 4](images/004.png)

蛋白水平：

![图片 5](images/005.png)

保留时间稳定性：

![图片 6](images/006.png)

半峰宽表现：

![图片 7](images/007.png)

最后是最重要的定量相关性：

![图片 8](images/008.png)

这样的结果是否符合您的预期呢？

然后让我们来看下血液的（未去高丰度）：

简单总结：平均单针定量230个蛋白，1600条多肽，半峰宽1.5秒，保留时间和定量相关小均非常稳定。

肽段水平：

![图片 9](images/009.png)

蛋白水平：

![图片 10](images/010.png)

保留时间稳定性：

![图片 11](images/011.png)

半峰宽：

![图片 12](images/012.png)

以及最重要的定量相关性

![图片 13](images/013.png)

从以上测试数据可以看到，超短梯度的灵敏度肯定差于长梯度，但对于相关高通量研究来说，通量应该能够满足大多数苛刻需求了。

采用易算的试剂盒2块96孔板/天的正常处理速度，质谱和前处理做到了真正的合二为一。

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