在鱼与熊掌尚不可兼得的时代,如果我们牺牲一部分灵敏度,能够实现多高通量的定量蛋白质组学检测呢?今天让我们看看最新示例:一天做180个样品!
样品类型:Hela细胞|人血
色谱柱:IonOpticks 5cm 快速分离喷针一体色谱柱
色谱梯度:U3000/M-Class 7.5分钟分离
质谱:Bruker Tims Tof Pro
检测通量:180个样品/天
Hela 定量结果
简单总结:平均每针定量检测到3600个蛋白质,16000个多肽,保留时间、定量相关性均非常稳定。
肽段水平:
蛋白水平:
保留时间稳定性:
半峰宽表现:
最后是最重要的定量相关性:
这样的结果是否符合您的预期呢?
然后让我们来看下血液的(未去高丰度):
简单总结:平均单针定量230个蛋白,1600条多肽,半峰宽1.5秒,保留时间和定量相关小均非常稳定。
肽段水平:
蛋白水平:
保留时间稳定性:
半峰宽:
以及最重要的定量相关性
从以上测试数据可以看到,超短梯度的灵敏度肯定差于长梯度,但对于相关高通量研究来说,通量应该能够满足大多数苛刻需求了。
采用易算的试剂盒2块96孔板/天的正常处理速度,质谱和前处理做到了真正的合二为一。
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