复旦大学生物医学研究院公共技术平台2020年的春季仪器培训将如期进行,本次培训为蛋白质组学技术专场,我们与上海易算公司合作,计划组织蛋白质组学及其相关技术的系列讲座,本次培训为系列讲座的第一期,介绍IBS公共技术平台常规的蛋白质组检测项目及其应用,邀请了几位从事蛋白质组研究和检测多年的专家老师授课,他们将在授课中分享检测中的实际经验和常见问题分析,讲座时间安排如下:
精确分子量和蛋白质组学常规检测 姚鋆老师 5月7日9:30-10:30
标记定量蛋白质组技术 晏国全老师 5月7日13:30-14:30
质谱靶向定量技术 张磊老师 5月7日15:00-16:00
蛋白组学数据分析方法 沈诚频博士 5月8日9:30-11:30
蛋白质组学生信分析 沈诚频博士 5月8日13:30-15:30
本期培训采用钉钉线上直播,培训为免费,旨在为复旦的师生提供一个了解学习蛋白质组学技术的平台
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平台及实验室简介:
复旦大学生物医学研究院公共技术平台2005年成立,目前已建成蛋白质组学、基因组与表观遗传学、分子细胞学、结构与药物、多功能影像六个子平台,这些平台以提供生物医学高端技术服务为目标,为复旦及其附属医院提供了重要的技术服务支持,其中蛋白质组学平台拥有各类生物质谱,色谱,这些仪器每年服务达到数万小时,承担了多项国家重点科研项目和各类测试服务,蛋白质组学技术平台曾多次获得获上海市科委优秀上海市专业技术服务平台称号。今年平台又新添置了几台目前世界最顶尖的生物质谱,包括Thermo公司的Exploris 480 FAIMS, Bruker公司的tims pro, Rapiflex MALDI-TOF-MS,这些仪器将为蛋白质组学研究提高有力的技术保障。
个人简介
姚鋆
毕业于复旦大学化学系,2006年加入复旦大学生物医学研究院。长期从事液相色谱-质谱联用、蛋白质组学相关技术和应用研究,具有丰富的蛋白质组学常规检测及高端质谱使用经验。
晏国全
复旦大学生物医学研究院生物质谱分析高级工程师
从事液质联用技术在生物大分子领域中的应用,主要进行蛋白质组学研究,生物色谱分离技术,蛋白鉴定、定量技术。
张磊
复旦大学生物医学研究院资深工程师,硕士学位,12年来管理LTQ-Orbitrap,4600Qtof,4000Qtrap,6500Qtrap四种质谱仪,擅长蛋白质组学各类定性定量技术和算法软件开发,4年来在以第一作者分别在Analytical Chemistry,Analytica Chimica Acta,Proteomics发表三篇技术和算法文章,在10余年漫长的服务中,以挂名或致谢支持了IF大于10的文章10篇以上,其中CNS主刊三篇,参与发表其余各类文章40篇以上。
沈诚频
复旦大学生物医学研究院分析化学博士,美国麻省理工访问学者,2004年起师从复旦大学生物医学研究院杨芃原教授从事蛋白质组学及生物信息学研究。致力于蛋白质组学最前沿的检测技术、分析软件推广,目前公司主要销售蛋白质组学分析软件Spectronaut,Peaks等以及围绕DIA技术应用所配套的色谱柱温箱、色谱柱,并提供相关生物信息学流程的开发和培训。在Nature Communications、化学领域国际顶级期刊Chem等杂志发表论文。
生物医学研究院IBS
生物医学研究院(Institutes of Biomedical Sciences,简称“IBS”)成立于2005年5月21日,细胞生物学和遗传学家贺福初院士受聘为研究院首任院长。2007年9月,遗传学家贺林院士受聘为研究院第二任院长。2013年至2016年3月,由常务副院长、分析化学家杨芃原教授主持工作。2016年4月,著名心血管病学专家、中国科学院院士、中华医学会心血管病学分会主任委员葛均波出任生物医学研究院院长。2017年2月,中国科学院院士、国际知名的表观遗传学家徐国良出任生物医学研究院执行院长。
研究院2009年获批承担上海市疾病蛋白质研究技术服务平台、2016年被科技部认定为 “医学表观遗传与分子代谢国际科技合作基地”、2019年获批成立上海市表观遗传调控重点实验室。研究院的使命是创建"中国第一、世界一流的生物医学交叉学术研究机构”,已经在生物医学交叉学科领域形成“代谢与肿瘤的分子细胞生物学”、“医学表观遗传学”、“系统生物医学”三个优势方向,并正在努力拓展转化医学研究和精准医学研究,包括老年医学、肿瘤和心血管疾病、肿瘤免疫、出生缺陷、靶点结构与活性小分子、组学与大数据、生物治疗与干预等,形成新的交叉学科生长点和下游技术。
研究院成立以来,始终坚持人才引进与培养并举,大力推进高层次人才队伍建设。目前全院120余名教职员工中,现有全聘课题组组长(PI)50余人,其中包括中国科学院院士2名,国家杰出青年基金获得者8人,长江学者特聘教授5人,国家“万人计划”领军人才5人,国家重点基础研发计划、重大专项首席科学家7人,青年长江学者4人,国家优秀青年基金获得者5人,其它国家高层次人才计划入选者10余人。
研究院成立至今,以第一作者(含共同第一作者)或通讯作者(含共同通讯作者)单位在国际顶尖杂志Nature、Science、Cell、New England Journal of Medicine上发表研究型论文15篇(其中单篇被引超过1000次的论文3篇),在Nature Genetics、Cancer Cell、Cell Metabolism、Molecular Cell、Nature Cell Biology、Nature Chemical Biology、Nature Microbiology、Nature Protocols、Nature Communications、Science Translational Medicine、Science Advances、Cell Research、Gene & Development、EMBO Journal、Molecular Psychiatry、Journal of Clinical Investigation、Genome Research、Hepatology等国际高影响力杂志上发表研究性论文100多篇,研究团队在组蛋白修饰、表观遗传调控、非编码RNA、结构生物学、蛋白组学、表观遗传与代谢交互调控、肿瘤代谢、人类遗传疾病、化学生物学等领域在国内外具有广泛的影响力,研究成果先后入选“中国科学十大进展”(2010)、“中国高校十大进展”(2010)、“中国十大医学进展”(2016),两项成果入选国际权威教科书。2014年研究院通过国际评估,专家评论“相关领域的研究水平已经接近美国顶级生物研究机构”。
生物医学技术支撑平台以提供生物医学高端技术服务为目标,历经十五年的建设,已建成基因组与表观遗传学子平台、分子细胞学子平台、结构与药物子平台、蛋白质组学子平台、影像和形态子平台、生物信息学子平台。技术平台现有10万以上设备289台/套(其中40万以上大型设备84台/套),总值约3.07亿元;专业技术服务人员31人;实验室面积约4400平方米;年服务机时约4.26万小时。
近年来,研究院在保持好高水平基础研究的发展势头之上,还积极与复旦大学附属的多家高水平医院(包括复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院、复旦大学附属肿瘤医院、复旦大学附属儿科医院等)进行深度合作,积极探索新形势下基础研究与临床科学问题相结合的研究模式,不断提升研究院转化研究水平。
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