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title: "3.2 基因（Genes）模块-Genes summary"
author: "omicsolution"
account: "omicsolution"
published_at: "2024-10-22T10:15:47+08:00"
captured_at: "2026-08-27T10:51:44.978507+08:00"
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# 3.2 基因（Genes）模块-Genes summary
单击报告顶部的“Genes”选项卡。基因模块提供输入到分析中的每个基因的详细信息。可以通过单击火山图中的基因，或从下面的基因表中来选择基因。您还可以通过其官方(HGNC) 基因符号或 Entrez 基因 ID 搜索基因。

选择一个基因后，会显示有关该基因的信息以及参考文献和与以下方面的关系：GO 生物过程、分子功能和细胞成分；KEGG 通路和药物；miRNA；单核苷酸多态性；疾病。单击与另一个模块相关的任何链接，您将进入相应分析。

如果您没有看到您感兴趣的基因被列出，您可以选择在火山图的右上角“show all genes”。这将显示用于生成分析的输入文件中的所有基因（显著和非显著）。从输入文件中加载所有基因可能需要几秒钟的时间。选择此选项时，将显示黑色和彩色点。红点（上）和蓝点（下）标识显著的 DE 基因，而黑点标识不显著的基因。请注意，火山图的比例限制为 10e6。

v请注意，当“show all genes”按钮被激活时，实验数据（即gene symbol, Entrez ID, logFC, adjpv的制表符分隔文本文件）、火山图可使用基因页面上方的向下箭头符号下载。

![图片 1](images/001.png)

当选择黑点时，与其他关系（如GO 术语和通路）的链接将指向其外源数据库，因为该基因在分析中未DE（且未考虑）。

![图片 2](images/002.png)

v iPathwayGuide 允许单独分析基因/蛋白质 ID，有或没有倍数变化或 p 值输入都可以。当输入具有倍数变化但没有 p 值的基因/蛋白质 ID 时，差异表达的基因显示为小提琴图（V iolin Plot）而不是火山图。而当输入的基因/蛋白质 ID 既没有倍数变化又没有p 值时，差异表达的基因显示在表格中。

![图片 3](images/003.png)