iPathwayGuide 仅根据 DE 基因数据预测可能在您的实验中活跃的 miRNA。我们假设 miRNA 的功能仅通过减少靶基因的丰度（例如，假设 miRNA 会导致观察到的靶基因下调）。

miRNA 分析有 5 个关键部分：

• miRNA摘要

• miRNA详细信息

• 差异表达的靶基因

• 网络分析

• 参考文献

miRNA摘要

在 miRNA 摘要部分，您可以通过单击图形右上角的标签在两种不同的视图之间进行选择。

计数视图                                     p 值视图

计数视图：

“计数视图”是一个条形图，显示每个 miRNA 下调的 DE 靶基因（蓝色条）和上调的 DE 靶基因的数量（红色条）。选定的 miRNA 条变为绿色和橙色，以表明其选择。默认情况下，miRNA 按重要性（从最重要到最不重要）排序，无需更正。

P 值视图：

纵轴 (-log10(pvn)) 是基于向下表达的 目标DE数量与 目标DE总数的 p 值。该 p 值用于识别重要的 miR。每个点的大小与该 miRNA 相对于其他目标基因的数量成正比。

横轴 (-log10(pv)) 是基于 DE 靶基因总数与靶基因总数的 p 值（忽略它们是上调还是下调） 此 p 值不用于识别显著的 miR。

图下方是一个表格，其中包含每个 miRNA 的相对计数和全局 p 值。默认情况下，不应用任何校正，但您可以选择应用 FDR 或 Bonferroni 校正因子。

miRNA 详细信息提供了 miRNA 的描述和指向 miRBase 的链接，以获取有关所选 miRNA 的其他信息，包括序列和茎环。

差异表达的靶基因

差异表达的目标基因图显示了所选 miRNA 的目标 DE 基因以及实验的相对检测倍数变化。目标DE从最大的负 FC 到最大的正 FC 排序。根据与所选 miRNA 相关联的 目标DE的数量，您可能需要向右或向左滚动表格以查看所有目标。单击基因的任何一个条形图都会将您带到基因选项卡以获取有关该基因的其他信息。 

参考文献

为选定的 miRNA 提供了相关的参考文献。可以通过在过滤器栏中输入术语来过滤这些参考文献。