--- title: "DIA技术最新应用：Cancer Cell发表易算客户结直肠癌转移研究" author: "omicsolution" account: "omicsolution" published_at: "2020-09-13T17:40:31+08:00" captured_at: "2026-08-24T11:50:16.844856+08:00" source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MTI5NDAzNg==&mid=100001058&idx=1&sn=ceb29e6ece645735bc262caa01e32e22&chksm=6a5dd7995d2a5e8f58f553e2e20d257842ccfd105dc0c0ba27852fea6b873590ec788562523e#rd" --- # DIA技术最新应用：Cancer Cell发表易算客户结直肠癌转移研究 DIA到底靠不靠谱，能不能替代各类传统蛋白质组定量方法？ 2020年9月3日，易算客户中国科学院分子细胞科学卓越创新中心曾嵘研究组及其合作单位，在Cancer Cell在线发表题为Integrated Omics of Metastatic Colorectal Cancer的研究论文再次为DIA技术背书。 ![图片 1](images/001.png) 该研究利用了Spectronaut独有的Hybrid DIA方法，结合DDA分级/单针和DirectDIA建库，共收集了165个DDA和564个DIA数据混合构建了包含11510个protein group的蛋白质谱图库，以及143个磷酸化DDA加519个磷酸化DIA样本构建了65851条磷酸化肽、9977个磷酸化蛋白质谱图库，并进一步DIA定量覆盖了8450个蛋白质Group和47786个磷酸化位点。平均每个样品定量成功6000个PG，20000个磷酸化位点。 在评价DIA定量可靠性的测试中，作者发现蛋白质和磷酸化DIA定量的技术重复CV为10%，而临床实际样品的蛋白质定量CV约为40%，磷酸化位点定量CV约为60%。 那么对于我们来说该研究可以借鉴的蛋白质组检测方法是怎样的呢？我们整理如下作为参考： ![图片 2](images/002.png) 以上DIA定量检测技术路线并没有特别难以重现的步骤，我们一般实验室在严格要求采样条件，严谨进行样品制备，控制色谱质谱质量后均能能够自我独立完成。 而且本文的DIA定量结果也进一步证明了易算所大力推荐的DIA定量技术路线的可靠性。我们将该研究的蛋白质组水平定量结果和今年发表的另一篇非标记定量研究结果A进行了对比： ![图片 3](images/003.png) 我们可以看到，虽然研究A定量到了多达11120个蛋白Group，但其50%样品可差异定量数量仅为5968个PG，同时可以看到每对样品定量蛋白也远远少于本文DIA的定量结果。因此DIA定量技术在定量重复性、稳定性上远远高于非标记定量，missing value比例远低于非标定量技术。从而大大降低了我们对临床样品进行分析的难度并使得我们的蛋白质组学结果能够更好的和其他组学进行对接。 易算生物针对临床大样本蛋白质组定量检测也推出了更易入门、更易实现的全套整合方案。 我们的核心思路是： - 自动化前处理 - 高效分离、可靠检测、设计严谨质控方案 - 选择最可靠、成本最低的定量路线 - 针对大样本设计数据分析和质控策略 ![图片 4](images/004.png) ![图片 5](images/005.png) 在以上新技术、新方法的加持下，大规模临床定量蛋白质组学对您来说轻而易举。 近期易算客户采用相关技术方案在没有丰富蛋白质组经验的背景下，通过易算全程实验指导，在111例临床血细胞研究中得到了非常理想的结果。 ![图片 6](images/006.png) 整个实验DIA定量实现了50%以上的PG 能够在100%样品定量，90%以上样品中实现了90%以上PG定量，平均每个样品定量成功4950-5100个PG。该结果也是目前已知的最高单针定量数量。 ![图片 7](images/007.png) 111例病人个体定量一致性也非常稳定，组内CV均在30%左右。 如您对我们的技术方案感兴趣，欢迎参考以下技术方案 - Mann 大规模定量案例Mann的首选，PreOmics iST与Spectronaut强强联手打造DIA最佳上下游方案 - Biognosys大规模定量案例如何对数千个临床样品进行大规模蛋白质组学检测你的 - 样品自动化前处理PreOn 蛋白质组专用前处理工作站 - Spectronaut DIA定量最新进展起飞，Spectronaut 14 测评 - 数据质控Quic 数据质控操作流程 - - 高稳定色谱柱你的RP够好么？聊聊RPLCMSMS里面色谱柱 - DeepDIA技术Nat Comm-易算与复旦携手发表DIA深度学习算法 如有您进一步咨询需求和合作意向。 欢迎和我们联系 www.omicsolution.com 若有任何疑问，欢迎邮件或来电咨询： marketing@omicsolution.com support@omicsolution.com +86-18221381405