EasyDIA，即使封城也可以让你的蛋白质组实验高枕无忧

原创 omicsolution omicsolution

连续监控5个月质控数据，期间还经历封城2个月、空调失灵1个月、更换3根色谱柱，还能做大队列蛋白质组么？这个问题不好解答，因为目前没有公认标准，那我们只能实打实的把数据都可视化出来，让您自行评判了。

上海这突然封城的2个多月，对于要求高精度、高稳定性的蛋白质组质谱来说，简直是地狱模式。尤其是对我们这种小小公司，没干啥呢就被关了禁闭，实在太难了。。。为了那点渺茫的希望，我硬扛着没关机，对着监控摄像头祈祷明天会更好。

艰难处境

封城前一周：

虽然我对封城有所预料，但迟迟不发货的试剂以及突然赶人走的物业只能让人无奈感叹；

封城第一周：

空调坏了一路，只剩一台小的艰难支撑，不过还好气温不高，还能扛，但后面要是不解封，这环境温度不敢相信，不过样品盘里也就只有Hela了，顺便跑一针吧；

封城第二周：

流动相没了，订的Fisher4个月了，还没到，彻底歇菜；

封城第3、4、5、6周：
温度忽高忽低，又觉得可能会解封，一直舍不得彻底停机，就这么苟延残喘

，

封城第7周：

反正不指望Fisher了，那就祭出屈臣氏大法，团购了一大堆。

封城第8周：

终于可以进人了，把流动相补足，顶着失灵的空调下33度的室温，颤抖的上了几针Hela。

100ng Hela 30min DIA noMBR 1%Precursor 1%Protein FDR

EasyDIA Time-series质控

基于极高灵敏度的nano-LC-MS体系，我们必须对每一个环节精益求精，才能尽可能保证出现不可控意外时产出的蛋白质组数据依然稳健可用。

因此，我们采用了iST试剂盒处理的Hela->ionopticks Aurora nano色谱柱>30分钟梯度 DIAPASEF（timsTOF Pro2）作为EasyDIA开发体系。每周采集一次数据，更换色谱柱采集一次数据用于评估色谱质谱状态，当然，拜疫情所赐，顺便检验了巨大的温度波动+更换流动相规格+无人维护的压力测试。那么肯定有客户会问了，搜个库做个鉴定就是质控了么？当然不是，10年前我们用蛋白定性数据质控，10年后还这样如何紧跟目前大队列定量的要求？

也有人说nano系统不稳定，还是改用micro或者常规流速体系适合大队列蛋白质组，不过我还是头铁，想要挑战挑战超高压（>650bar）体系下nano-LC-MS系统的长久稳定性。谁让我们心心念念着一小时上万呢？

因此，我们必须全方位的考察我们的系统能否经得起大队列的压力考验。那需要考虑的因素就包括液相系统、质谱系统，定性结果，定量结果等多个方面了。这种情况下的质控实操可就麻烦了，不过为了满足质控的要求，我们开发了EasyDIA平台，能方便的提供全自动质控分析。部署EasyDIA后，只需要把原始质谱数据保存到对应目录，过一会儿质控结果即刻展示。

体验网址：

ttps://project.omicsolution.com/EasyDIA/?time_series_qc 或点击文末的阅读全文