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title: "EasyPept DeeP低丰度蛋白富集联用AUTO100自动化效果"
author: "omicsolution"
account: "omicsolution"
published_at: "2023-12-05T20:07:23+08:00"
captured_at: "2026-08-27T10:51:43.974905+08:00"
source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MTI5NDAzNg==&mid=2247492971&idx=1&sn=44831b5495fd8f5b34d4c52c04775852&chksm=ea5e37d0dd29bec689ca2bf3739ba57c564de726b914f176d31173a03c46fff4fcfa168cd324#rd"
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# EasyPept DeeP低丰度蛋白富集联用AUTO100自动化效果
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您可能看过很多广告说能够检测到多少血液蛋白质，结果有多理想，但如果欠缺实际数据的话，有可能又会心存疑虑，不确定这些结果的水分所在。

而易算也曾经宣传过易肽DeeP产品的检测深度，今年来也有大量用户好评，但由于毕竟时间不长，可能没有较多文献的支持。

我们最近自己DIY一把，联用低丰度富集和我们的AUTO100自动化工作站测试了125例的实际血浆样品作为一个实际数据集供您了解质谱对人血检测的一个大概情况。（数值经过了变换保密处理，但数值大小和实际情况接近，可作参考）

方法概括：

采用易肽DeeP试剂盒联用AUTO100自动化，在7-8小时内完成所有样品的自动化制备。

timsTOF Pro2 DIAPASEF方法检测，Spectronant18 directDIA（无额外谱图库，swissprot human 20000条蛋白序列fasta）定性、定量采用默认参数分析。

结果大致如下，24SPD方法平均定量约4000种protein group，共定量约6000种Protein Group，高通量120SPD方法平均定量3300种Protein Group。

![图片 1](images/001.png)

![图片 2](images/002.png)

我们采用质控平台 EasyDIA对该数据集进行了可视化，方便广大用户对其中的蛋白质种类、基因种类、相对定量丰度、多肽种类及丰度，整体数据定性、定量的质量进行了汇总，您可以点击文末阅读全文查看该数据集。

EasyDIA可视化血液大队列结果包括如下部分：

蛋白质定量列表（蛋白质ID，基因名称，各个样品的Spectronaut DIA定量值）

肽段定量列表额外基于检测到的各个蛋白的多肽序列可视化其定量信息。

以上信息均经过随机化处理，数值与实际检测值接近但不同。

整体质控信息包括：

蛋白、多肽等检测数量的分布折线图

漏切分布折现图

数据一致性趋势图

MS1，MS2的TIC粗略分布

检测成功的母离子、碎片离子和RT的相对量分布

色谱半峰宽分布

子离子XIC定量数据点数量分布（DPPP）

峰容量分布

一级、二级质量轴精度分布

定量CV、相关性、强度等分布

蛋白丰度分布

有了这些信息您可以充分了解质谱对血液蛋白检测的能力范围，在进行实验前预估结果是否可能符合预期。节约时间、提高效率。

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