易肽EasyPept Ex OSFP0004:8x,96x

试剂盒基本说明
| 说明 | |
适用范围 | 蛋白、体液、组织切片(冷冻或FF),约相当于100~10000个普通大小细胞量 |
| 包装规格 | 8x,96x 或定制规格 |
| 试剂组成 | 裂解液、还原烷基化、酶、除盐tip |
| 处理速度 | 不超过3小时 |
| 多肽得率 | ~40%(起始蛋白) |
| 自动化适配 | 适配EasyPept Auto |
| 适用实验类型 | DIA,DDA定性、定量实验。不适合标记定量 |
从蛋白到多肽仅需2个多小时

图1:实验流程简介

图2:操作步骤示意(蛋白量仅为示意,以实际采购试剂盒适配量为准):
结果展示:
一、微量细胞实验
实现20个细胞1500+PG的定量深度

图3:质谱检测timsTOF pro2 60minDIAPASEF(12个分级HybridDIA)
联合EasyPept Auto自动化工作站处理结果,自左向右依次为1000,500,100,20个Hela细胞,全部为生物学重复(1% 蛋白Group,Precursor FDR)。

图4:图3对应的不同量细胞的定量相关性图(从左上到右下依次为100,1000,500,20个细胞)

图5:不同数量细胞PCA分布图

图6:中间插入Blank的TIC
二、实测样本,流式分选神经元细胞定量蛋白质组
来自流式分选的小鼠神经元细胞,24个分级建库结合Spectronaut16 HybridDIA定量流程。最终实现了单针超过10000种蛋白质Group的定量深度,总定量蛋白11000种蛋白Group(1%PG,Precursor FDR)。

图7 采用Ex试剂盒处理的神经元细胞定量深度
三、微量组织切片对比(约100um级别冷冻切片)
来自微量冷冻切片的脑组织不同区域,12个分级建库结合Spectronaut16HybridDIA定量流程。最终约250个样品实现了单针平均8200种蛋白质Group的定量深度,总定量蛋白9300种蛋白Group(1%PG,Precursor FDR)。

图8 采用Ex试剂盒处理的微量脑组织切片定量深度
四、组织FFPE切片对比(<1mm*1mm*0.02mm FFPE)
来自FFPE切片的肝组织,12个分级建库结合Spectronaut16Hybrid,1小时DIAPASEF定量4500PG(客户内部测试)。
更多、更小面积结果敬请期待。
以下设备需额外准备:
恒温混匀仪

提供95℃及37℃的恒温条件,促进蛋白质的裂解与酶解,96x版本请准备相应模块
2.离心机

96x版本请准备96孔板离心机及其挂架
3. 组织、细胞样品的破碎
0.5~5mg组织,建议使用Beatbox。更低样品量非接触式超声或直接加裂解液加热即可。
产品列表:
| 品名 | 货号 | 规格 | 说明 |
EasyPept Ex | OSFP0004-8 | 8X | 最多处理8个样品(仅供第一次采购测试) |
| OSFP0004-96 | 96X | 最多处理96个样品 |
| 产品负责人 仝冰润 具有丰富的样品制备经验 |
