高分辨质谱仪到底产出怎样质量的数据才能算合格?目前还没有非常公认的标准,很多实验室都会用T家的商品化标肽进行日常质控,但这个实在太贵了。有细胞房的实验室会自己养细胞做标品,但缺乏标准化的前处理工具,批次间结果一致性差并且总体结果往往差于商品化标肽,难以进行长期维护和横向对比。此外,即使采用了商品化标肽,如果缺乏相关经验,也只能看下鉴定蛋白数和质谱刚装机的时候进行对比得到非常粗糙的对比结果,不知道如何从结果中排查异常原因更不知该如何优化。
如今随着质谱的易用性越来越高,大队列多组学实验也成为了许多课题的标配,大队列蛋白质组实验对样本收集、前处理以及色谱和质谱的一致性和性能的稳定性提出了更高的要求。如何评估实验各个环节的质量和一致性,如何确保珍贵的临床样品得到最佳的检测结果呢?
下图是我司为蛋白质组学设计的整体质控流程:

注:易肽STDT为我司采用标准流程收集的细胞、组织、体液样本,可用于样品制备阶段的质量控制,敬请期待。OmicsCloud数据质控平台为易算自主开发的数据质量综合评估平台,可同时对包括样品制备、色谱和质谱性能在内的20+种参数进行评估,为数据质量控制和方法优化提供最全面的指导,如需了解更多,随时联系我司。
其中本产品易肽STDP 质控标肽试剂盒是基于iST前处理制备试剂盒制备的大肠杆菌,Hela细胞,小鼠器官组织,拟南芥组织或血浆样品的多肽,适用于客户不同实验体系下的LC-MS系统性能评价。后续,我们会进一步推出磷酸化、N糖基化标肽以提供PTM实验的质控。
产品特点
成本低廉,远低于同类商品化标品
经由ist方案制备,结果优秀,高度接近同类商品化标品结果
种类丰富,可作为同类组织器官提取的参考标准
典型质控结果:还原烷基化15%,氧化<5%,脱酰胺化<5%,漏切~10%,无人为引入非特异性修饰
产品信息
标肽类别 | 物种 | 规格 | 货号:OS | 典型蛋白 | 测试体系 | 供货情况 |
Hela细胞 | 人 | 10μg | STDP | 6500 | 质谱:Tims-TOF Pro 2; | 现货充足 |
血浆 | 人 | 10μg | STDP | 600 | 现货紧张 | |
全脑 | 小鼠 | 10μg | STDP | 6600 | ||
肾 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7000 | ||
肌肉 | 小鼠 | 10μg | STDP | 4500 | ||
胫骨/无骨髓 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7000 | ||
脂肪 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7000 | ||
胰 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7500 | ||
肝 | 小鼠 | 10μg | STDP | 5000 | ||
心脏 | 小鼠 | 10μg | STDP | 4500 | ||
胃 | 小鼠 | 10μg | STDP | 6000 | ||
肠道 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7000 | ||
脾 | 小鼠 | 10μg | STDP | 5500 | ||
睾丸 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7500 | ||
子宫 | 小鼠 | 10μg | STDP | 7000 | ||
细菌 | 大肠杆菌 | 10μg | STDP | 4000 | ||
拟南芥 | 10μg | 待加入 |