1 说明
IPA科学家们手工绘制了800多种生物信号通路和代谢通路,在Canonical Pathways分析对与实验数据最相关的失调通路进行打分,查看背景知识和支持文献,查询通路分子互作实验信息,利用Build,Overlay和Path Designer工具对通路进行个性化编辑与扩展。另外IPA独有的z-score算法也涵盖了近200种通路的激活抑制调控情况分析,从而快速找到明显失调的相关通路。
重要提示:部分研究的分析结果会发现 acute phase response signaling, mitochondrial dysfunction, TCA cycle, Lipid metabolism结果非常相关,但根据我们的经验这些通路都属于恶性疾病均会出现失调的通路,不一定对您的研究有很大帮助
2 结果内容
l结果表格
l柱状总结图
l详细调控通路图
3 结果柱状图
l从图中可以获得的信息:
l图例说明:上图展示最相关的经典通路,并以-log(p-value)进行排名。橙色柱图对应通路为预测激活的通路;蓝色柱图对应的通路为预测抑制的通路;灰色通路是暂时无法自动打分预测;白色通路为目前暂时没有足够证据预测其激活、抑制。
l柱状图主要用于快速展示通路相关性结果,也就是表格的图形化变换。
4 详细调控通路图(手动)
l光通过通路名称并无法快速判断通路变化是否对课题有帮助,因此需要对可能有意义的通路进行详细分析。