1 说明

该模块分析差异蛋白可能的上游调控因子，分析原理如下图：

2 结果内容

l结果表格

l转录调控网络图

l相应网络文献判别证据及其文献总结

l转录因子互作网络图

1.3 结果表格

l参数说明：

Upstream Regulator是IPA预测的可能调控提交数据集中那些发生变化分子的上游调节子，Fold change显示该调节子如果同样在本数据集中有发现，其变化倍数值；Molecule Type是该调节子的分子类型；Predicted Activation State为IPA预测的该调节子可能的活性；Activation z-score衡量了该现象发生的可能性，该值的绝对值越大表明可能性越高，也就是说明下游基因表达变化和该调节子可能的调控关系越一致；p-value表明提交数据集中的分子可能被上游调节子调控的随机匹配的概率，越低表明概率越小，此值不考虑上下调信息一致性，只考虑该基因是否与该上游调节子相关；Target molecules列出数据集中的相关分子；mechanistic network用于预测转录调控子互作。

l从表格中可以获得的信息：

l最主要信息是A列，预测可能调控本实验差异蛋白的上游信号源，D列，快速查看相关调控子可能的调控活性；C列可以筛选需要分析的上游调节子分子类型。

4 转录调控网络图(手动）

IPA提供各个转录调控子的调控网络图，如AGT调控网络

5 相应网络文献判别证据及其文献总结(手动)

在进一步对感兴趣的调控因子进行讨论和验证前，我们可以参考IPA给出的文献依据进行确认。和功能网络文献总结类似，我们可以看到AGT调控的本实验中差异表达的21个蛋白，其中17个的变化趋势与INSR失活后可能导致的变化一致，4个蛋白不一致。同样最右列的数字链接可以获取其支持文献信息。