质谱综合数据分析平台 - 让质谱组学数据分析更简单、更高效
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OmicsCloud是一款易算自主开发的web应用平台，旨在为用户提供常见的生信云平台功能以外，更可以整合实验室内质谱及其数据分析软件(如Spectronaut）的一体化分析工具
序列数据库本地化管理、升级、注释
质谱组学全流程分析
个性化作图工具
深度自定义流程
自定义分析报告
用户注册、登录
自定义权限
基于权限的内容控制
管理员界面
支持本地部署，部署后即可支持：
多项目负载均衡
大队列分布式计算
完整的蛋白质组学数据分析解决方案，包括蛋白质序列在线下载、注释；基于Spectronaut软件的在线数据检索等功能
智能化数据库构建与管理
多源数据支持
支持UniProtKB，NCBI或自主测序数据库
自动注释及管理
GO、KEGG、STRING等功能注释，并进行注释结果统计确保效果
自定义FASTA
支持上传自定义序列文件并自动化后台注释
下游自动化联用
支持注释所用fasta直接联用Spectronaut搜库，无缝衔接全流程分析
基于Spectronaut的智能搜库系统（可定制其他软件）
DirectDIA
无需建库的直接DIA分析（须采购spectronaut）
支持多负载均衡，采购Spectronaut多用户license后可以将海量任务分发到多台计算机进行分析。
Cohort real-time Search实时搜库模式
边采集边分析，节约时间。
支持集群化管理、任务分配和大队列分布式计算。（Windows、Linux均可）
实时查看分析进度，分析结果。
Time-series
长期质量监控自动分析
异常预警
实时监控数据质量
全面的数据质量监控体系，基于搜库流程中的Time-series模块开发而来，为每个分析项目都提供质控功能
项目质控
20+项质量指标实时监控
自动报告
质控报告自动生成
从原始数据到生物学洞见的完整分析链条，本功能既可以独立使用也可以联用质谱数据分析模块进行全流程一体化分析
数据导入
支持多种表格数据
数据预处理
归一化、缺失值填充
统计分析
差异分析、假设检验
功能注释
GO、KEGG富集分析
可视化
交互式图表生成，并可个性化编辑
数据归一化
中位数、均值、总数标准化，Z-score转换，Log转换等多种归一化方法，降低实验误差，提升定量精度
缺失值处理
KNN、Sequential KNN、多重填补、C4.5决策树等智能填充算法，最大程度保留数据信息
统计分析
t-test、ANOVA、Wilcoxon等多种假设检验，FDR校正控制假阳性，确保结果可靠性
OmicsCloud积极响应用户的分析需求，在常规定量组学的基础上正在逐步迭代各类分析路线包括但不限于：
非靶代谢组分析
蛋白质组PTM及PTM联用蛋白组分析
多肽组学分析
单细胞蛋白质组学
空间蛋白质组学
药靶蛋白质组学（LiPMS，TPP，Pelsa等）
蛋白质组定量可靠性评估
交互式数据可视化平台OmicsGraph支持分析结果作图个性化订制，亦可直接上传数据表格直接进行个性化作图。
火山图
展示差异表达分析结果，直观显示显著差异的蛋白质
聚类热图
层次聚类分析，展示样本间相似性和蛋白表达模式
PCA/PLS-DA
主成分分析和偏最小二乘判别分析，揭示组间差异
KEGG通路图
代谢通路富集分析，理解生物学功能
GO富集图
基因本体富集分析，多维度功能注释
和弦图
展示蛋白质相互作用网络关系
完全可定制
字体、线条、标题、坐标轴、图例等所有元素均可编辑
交互式操作
支持缩放、拖拽、高亮等交互功能
多格式导出
支持PNG、SVG、PDF等多种格式导出
报告联动
分析报告中的图表可通过API实时更新
独立使用
可单独上传数据进行可视化
模板系统
基于轻量级标记语言，支持HTML/PDF导出
可视化编辑器
所见即所得的编辑体验
模块化设计
预置报告模块，快速组装专业报告
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