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title: "SpectroMine--革新鸟枪法蛋白质组学数据分析"
author: "Omicsolution"
account: "Omicsolution"
published_at: "2019-04-06T15:28:54+08:00"
captured_at: "2026-08-24T11:50:18.421237+08:00"
source_url: "https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2MTI5NDAzNg==&mid=100000458&idx=1&sn=8c566df1de49be5927d657afece6e7fc&chksm=6a5dd0715d2a5967cbd6f3cb2194dd771ce5c2a2ac4c89837cf5517785fcc14bd107073173b9#rd"
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# SpectroMine--革新鸟枪法蛋白质组学数据分析
![图片 1](images/001.png)

革新鸟枪法蛋白质组学数据分析&超快、深度覆盖、高精度定量

近年来同位素标记定量技术日益更替和改进，使其在鸟枪法蛋白质组学定量分析中得到越来越广泛的应用。Biognosys作为数据非依赖采集技术（DIA）的共同发明人现如今也致力于将各类蛋白质组定量技术进行整合，开发了SpectroMine能够分析各类采集类型的质谱数据的软件，从定性、到DDA非标以及各类报告离子定量数据的分析。

主要功能：

1. DIA,DDA和PRM数据的搜库定性：支持对多种数据采集类型结果的同时分析。

2. 超快，支持超过1000个run的数据分析：创新的算法能够大大节约内存消耗，使得采用普通桌面电脑就能分析1000个以上的run，同时分析速度极快，一般5分钟左右即可分析完毕一个2小时的Fusion DDA数据，1小时即能分析完一整套ITRAQ定量数据。

3. 高可信度的统计方法：支持从肽段到蛋白水平的FDR质控。

4. 差异定量分析：基于非标记（LFQ）、报告离子标记（ITRAQ, TMT, EASI-TAG）的定量分析功能（DIA及PRM分析请使用Spectronaut和SpectroDive）。

5. 支持内嵌GO分析：内嵌GO分析及富集模块可以快速发现相关功能变化。

软件特性

![图片 2](images/002.png)

SpectroMine采用了Biognosys独家开发的Pulsar搜索引擎，将搜库速度提升到了极致，同时支持DDA，DIA，PRM数据检索。SpectroMine具有启发式计算功能，将计算速度提升至极致。

在台式机CPU为i9-7960X平台上， 我们测试了50万张MS2谱图的ITRAQ数据，分析时间仅为1小时。

![图片 3](images/003.jpg)

我们总是致力于获得尽可能多的蛋白质鉴定量。SpectroMine在实现Protein和Peptide两个层次同时FDR控制的情况下，能够实现高精确、高覆盖的定性数量。

![图片 4](images/004.jpg)

SpectroMine的一个重要设计初衷便是充分支持同位素标记定量isobaric labeling quantification (ILQ)，目前支持iTRAQ，TMT，EASI-TAG等标记定量方式。EASI-TAG定量是最新的大大降低常规iTRAQ/TMT定量压缩效应的替代方法，具有和真实差异极为接近的定量效果。即使在2个物种混合蛋白质组定量时，都能保证准确的定量结果。

支持的仪器

• Thermo Scientific Q Exactive Series

• Thermo Scientific Orbitrap Fusion Series

• SCIEX TripleTOF Series (5600, 5600+, 6600)

• Bruker Impact II

• Bruker timsTOF without ion mobility

• Waters Xevo G2-XS

如果您想了解更多关于Spectromine软件可联系我们：support@omicsolution.com！
