[更新 20.2.250922.92449]
- 提升混合工作流程（无标记+标记/Spike-In）中RUN级别蛋白质FDR的稳定性
- 进一步强化多种复杂场景下的FDR控制鲁棒性
- 在多种生物数据集（n=35个数据集）中提升timsTOF和Orbitrap Astral的蛋白质鉴定率（平均+4%）
- 修复directDIA模式下通过CMD或流程从PSAR扩展库时生成PSAR文件出现的"进程无法访问文件""process cannot access file"错误
- 将"缺失修饰定义""missing modification definition"的处理方式改为中止流程而非从搜索中移除
- 改进无鉴定结果（空原始文件）搜索的异常处理机制
- 修复外部源（如MSFragger）导入的谱库与SN PTM定位算法不兼容的问题
- 修复使用"All Matching Proteins"推断策略时可能出现的蛋白质组重复问题
- 修复"Use All MS-Level Quantities"未应用于PTM水平调控分析的问题
- 增强IDPicker算法的可追溯性
- 修复全局cScore归一化可能导致鉴定数大幅下降的问题
- 修正Astral仪器"max fill-time reached"的错误读数
- 修复多个修饰占据同一位点时谱库生成过程中的解析错误
- 修复Kuiper（用于非特异性搜索或PTM probing搜索）的内存泄漏问题
- 改进关闭窗口时的图形界面内存清理机制
- 添加应用程序即将耗尽图形句柄时的用户警告
- 修正分析日志中错误数量统计不准确的问题
- 修复同一台计算机上多次分析实验时可能产生非确定性结果的问题
- 修复负修饰质量（丢失）可能导致MS2索引崩溃的问题
- 修复多个Spectronaut实例同时启动时酶数据库文件访问的潜在竞争条件问题
- 修复Linux系统manageSNE命令生成空分析