Uniprot是蛋白质组学界非常重要的数据库,几乎每个质谱实验室都要天天和uniprot的序列文件打交道,最近Uniprot网站改版,有了新的外观,改善了用户体验并便利了您在蛋白质科学世界的探索之旅。

今天我们简单介绍下改版内容和新的功能,方便大家快速找到自己喜欢用的工具。
首先您可以通过简单的搜索找到您最喜欢的蛋白质 - 例如,通过在搜索框中输入“血红蛋白(hemoglobin)”或功能描述“细胞凋亡(apoptosis)”,甚至是疾病名称,例如“囊性纤维化(cystic fibrosis)”。

在新的“卡片视图”中有许多可以点击的地方,但通过选择一个物种或通过使用左侧菜单将结果限制为经过审查、专家注释的条目,可以轻松地将您的搜索结果过滤为更精炼的数量。
卡片视图提供了您可以在每个条目中找到的数据的快速概览 - 例如,CFTR 蛋白质有 210 个经过审查的变体和 38 个 3D 结构。条目按内容量排名,因此您将始终在搜索顶部看到信息最多的条目。

Uniprot已将ProtVista 功能查看器直接嵌入到条目中,以便您可以同时查看和阅读有关蛋白质序列特征的信息。

您还可以在由Alliance for Genomic Resources开发的汇总功能区视图中查看结构化的 Gene Ontology 注释。

您可以查看蛋白质 3D 结构 - 不论是实验性(可用时)还是 AlphaFold 预测的结构(http://insideuniprot.blogspot.com/2021/07/)。

并查看使用 SwissBioPics 绘制的蛋白质的亚细胞定位。

如果您对Uniprot数据库的更多应用场景感兴趣,欢迎关注我们的公众号,后续我们将陆续推出相关专题介绍。
往期资料:Uniprot中如何选择fasta?我只能帮到你这里了
【点击阅读原文即可访问新版本网站】