什么是iPathwayGuide?

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iPathwayGuide是什么？

iPathwayGuide 是一种基因表达分析工具，可从高通量测序生成的数据中提供生物学背景和推论。iPathwayGuide 利用系统生物学方法来识 别显着影响的信号通路、基因本体术语、疾病过程、预测的 microRNA 和基于给定差异表达特征的推定机制。

通过使用称为影响分析的新型分析方法，iPathwayGuide 考虑了通路中每个基因的作用、位置和关系，从而显着减少了假阳性，并更好地识别真正受影响的通路和假定可以解释所有测量的基因表达变化的机制。

它是一种基于 Web 的、用户友好 的交互式工具，不需要事先接受生物信息学培训。

它可以接收哪些数据类型？

Gene expression/Transcriptomics

mRNA (RNA-seq)

total RNA (RNA-seq)

mRNA (microarrays)

mRNA (Nanostring)

Proteomics

protein (mass spec)

protien (Nanostring)

phosphor-protein

Epigenomics

ChIP-seq

ATAC-seq

RBRS

Hi-C

Methylomics

Other

User-defined data type

拥有它能获得什么？

iPathwayGuide 中的六个结果选项卡。

你可以通过单击选项卡，轻松地从一个结果部分切换到另一个结果部分。

比如，摘要页面包含带有应用阈值描述的火山图、双向路径图以及每次分析的前十个结果。可从左下角的摘要页面（红色箭头）访问可打印的报告摘要。你可以通过单击屏幕右上角的共享并输入你想要与之共享报告的人的电子邮件地址，来轻松共享分析结果。

哪些人用了iPathwayGuide？https://advaitabio.com/customer-stories/在这里。

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