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去高峰度太贵、不去高丰度太少
普筛可靠性欠佳、靶向数据不完整
临床血液蛋白质组学令人头疼的问题大家都知道,那该如何取长补短,得到更完美的结果呢?
去年我们就发布了PQ500 同位素人血标肽定量试剂盒,用于同时对人血蛋白进行快速绝对定量研究,但受限于质谱扫描速度和双倍复杂度的待检肽段信息,可同时绝对定量的蛋白只能保持在300多个。最近,全新的Thermo Exploris 480质谱结合新的SureQuant技术,把靶向定量PRM技术进一步推向更高通量。我们因此也进一步尝试将该方法与PQ500联用及优化。

基于SureQuant和PQ500的质谱检测流程

基于SpectroDive的数据分析流程


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更低丰度的蛋白,更丰富的信息
血浆中低丰度蛋白中相当一部分蛋白可能来自于组织、细胞分泌到血液中的,因此这些蛋白的额外定量可以提供更丰富的信息和潜在靶标候选。
在PQ500+SureQuant的一个最佳应用场景,血液长期变化研究中能够得到更加全面的信息。
比如在对非小细胞肺癌病人血浆样品的检测中,我们可以在中丰度蛋白中定量到详单部分的C5a补体蛋白、S100家族蛋白、应激反应通路相关的非血液高丰度蛋白。

结语
通过识别同位素标肽触发采集可以大大减少PRM实验中的无效采集信息;
而通过联用优化过的PQ500+SpectroDive分析流程,同时绝对定量500+血液蛋白不再成为难题;
从我们的实验结果也可以看到,该方法相对于MRM实验提升1个数量级的检测限。
