2020年8月,悟空云运行第50个月,更新第29版,让我们简单看下更新内容吧:

1. 新增COG数据库匹配模块:

  位于功能圈:功能分析 第25个工具


2. 新增GSEA GO富集分析模块:

 

 位于功能圈:功能分析 第26个工具 


3. 优化普通分组散点图模块(添加转换后数据结果展示功能,方便用户直接查看或者下载转换后数据结果):


4. 优化MetabogroupS模块(本次主要优化原始数据导入部分,以前版本的原始数据导入形式容易给用户造成误解(比如QC样本数据是不是一定要的放到整个表格的前面,其实是不用的),优化后,用户可以直接按照示例数据形式准备好定量数据和样本信息数据导入即可):

 

5. 优化假设检验模块(新增考虑这样的数据情形,就是用户上传的数据已经经过取对数处理,那么记得按照提示勾上对应的参数,并将‘取对数类型’选择为None):

 

6. 优化带圈散点图模块(优化后,3个点也可以画出置信椭圆):

想要更多了解悟空云的,也可以参考我们的往期推文:

1. 悟空云数据分析交流_第一期

2. 悟空云数据分析交流第二期之组缺失值填充NAGuideR工具

3. 悟空云4周年,Nucleic Acids Research发表NAguideR缺失值填充评价工具


目前基于悟空平台开发的分析工具已发表以下文章:

NAguideR模块:

(2020) Shisheng Wang , Wenxue Li, Liqiang Hu, Jingqiu Cheng, Hao Yang, Yansheng Liu, NAguideR: performing and prioritizing missing value imputations for consistent bottom-up proteomic analyses, Nucleic Acids Research, gkaa498. (IF: 11)

motifeR模块:

(2019) Shisheng Wang , Yue Cai, Jingqiu Cheng, Wenxue Li, Yansheng Liu and Hao Yang. motifeR: An Integrated Web Software for Identification and Visualization of Protein Post‐Translational Modification Motifs. Proteomics: 201900245. (IF: 3). 

pseudoQC模块:

(2019) Shisheng Wang and Hao Yang. pseudoQC: A Regression‐Based Simulation Software for Correction and Normalization of Complex Metabolomics and Proteomics Datasets. Proteomics: 1900264. (IF: 3). 

MetaboGroupS模块

(2018) Shisheng Wang , ..., and Meng Gong. MetaboGroupS: A Group Entropy-Based Web Platform for Evaluating Normalization Methods in Blood Metabolomics Data from Maintenance Hemodialysis Patients. Anal Chem 90, 11124-11130. (IF: 6). 

MixProTool模块:

(2018) Shisheng Wang , ..., and Hao Yang. MixProTool: A Powerful and Comprehensive Web Tool for Analyzing and Visualizing Multigroup Proteomics Data. Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology 25, 1123-1127. (IF: 1). 
同时悟空平台整合上百个分析模块,包括且远不止以下功能

而围绕上游质谱数据解析和下游组学应用,我们近期也发表了多篇文章:
(2020)Yi Yang, ..., and Liang Qiao In silico spectral libraries by deep learning facilitate data-independent acquisition proteomics. Nature Communications
https://doi.org/10.1038/s41467-019-13866-z (IF:13) 
(2020)Shuping Long, ..., Liang Qiao Metaproteomics characterizes human gut microbiome function in colorectal cancer. npj Biofilms and Microbiomes 
https://doi.org/10.1038/s41522-020-0123-4  (IF: 18)
(2020) Rutan Zhang, ..., Liang Qiao Proteomic and Metabolic Elucidation of Solar-Powered Biomanufacturing by Bio-Abiotic Hybrid System. 
https://doi.org/10.1016/j.chempr.2019.11.002 (IF:5)

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