第四期课程回顾&预告 | 2026年第一届蛋白质组学理论与实践公益暑研班

本周课程系统讲解质谱数据搜库相关原理、软件操作、参数设置与整套质控流程，梳理日常分析工作中的关键要点与优化方案。配套文献分享以及企业专场，分别围绕睡眠稳态调控分子机制、单细胞蛋白组、血浆临床蛋白组高通量解决方案展开分享，参训人员结合内容参与交流探讨，既巩固了蛋白质组数据分析实操能力，也及时了解行业前沿技术与基础科研最新进展，为后续开展样本项目分析、机制研究提供有效参考。

一、培训课程

在本周的第一节培训课程中，王徐飞老师聚焦蛋白质组学数据分析难题，系统对比了DDA 与 DIA两种质谱采集技术的核心差异。DDA 依赖一级信号筛选采集数据，易遗漏低丰度肽段、定量随机性高，而 DIA 全覆盖采集母离子窗口，凭借二级碎片定量，准确度和蛋白覆盖度更优。她对比了主流搜库软件的适用场景，DIA-NN 适配短梯度、小样本研究，Spectronaut 更适合复杂样本与大队列分析。同时指出色谱梯度时长影响数据质量，长梯度能显著提升定量准确性与验证成功率。最后补充特殊蛋白组分析场景仍需依托 DDA 技术，明确了两种技术的互补适用边界。

在第二节课程，王徐飞老师系统讲解 Spectronote 开展 DIA 数据搜库的完整实操方案，推荐采用 library-free 无谱图库模式提升低丰度肽段鉴定效果，并规范酶切、蛋白修饰、污染库等基础参数设置。她介绍多层级 FDR、iRT 保留时间校正、归一化方式等质控手段，保障大队列数据定量稳定可靠。同时讲解修饰组整合分析、诱饵库构建等高级功能，并提醒大规模分析需要充足硬件内存支撑。

二、前沿学术报告分享

主讲人：曹华腾   复旦大学义乌研究院 青年研究员

报告主题：

《Tryptamine from wake-active monoaminergic neurons regulates sleep homeostasis》

曹华腾研究员围绕睡眠稳态调控机制，揭示了色胺 - GPR139调控通路的全新神经机制与临床价值。团队证实色胺是核心睡眠压力分子，睡眠剥夺后浓度显著升高，可浓度依赖性提升睡眠质量、延长睡眠时长。该分子主要由觉醒相关脑区的单胺能神经元经 ADC 酶合成、囊泡释放，释放量与觉醒时长正相关。其通过激活视前区抑制性神经元的 GPR139 受体，抑制觉醒核团活动，以此调控睡眠稳态。此外，该通路进化保守、与人类失眠相关，GPR139 激动剂具备新型安眠药物的开发潜力。

主讲人：郭志勇  北京生命科学研究所 刘清华课题组博士后

报告主题：

《Phase separation, synaptic transmission and sleep amount》

郭志勇老师围绕睡眠激酶 Sleepy 开展机制研究，证实突触传递强度能够双向调控小鼠睡眠时长。研究鉴定出 SAPAP3 为 Sleepy 直接磷酸化底物，该蛋白特定位点磷酸化会改变突触后致密区相分离特性，减弱受体锚定作用。该调控通路进化保守，相关基因突变和人类失眠相关，完善了突触稳态假说，为靶向突触磷酸化开发促眠新药提供新靶点。

 三、企业专场

主办方：杭州纽辰、上海埃飞

在企业专场中，上海埃飞首先介绍了 CellenOne 单细胞蛋白组一体化制备系统，依托声波分选与多通道图像识别技术实现温和、高效单细胞分选。平台支持芯片与 384 孔板全自动化前处理，配套 TMT 混标、非标两套实验方案，可显著提升样本通量。该系统兼容微量样本、空间组学、转录组 + 蛋白组双组学等多种研究场景，有效缓解单细胞实验通量不足的痛点。

杭州纽辰展示多款蛋白组高通量分析方案，高速液质平台支撑大规模蛋白组研究；依托 4D-DIA 质谱开展血浆蛋白组分析，挖掘神经退行性疾病相关标志物；同时具备单细胞蛋白组技术，可兼顾单细胞与血浆大队列检测需求。

错过之前课程的同学不必遗憾，暑研班后续精品课程持续更新，助力大家从零系统掌握蛋白质组学全链路科研技能！