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OSFP0005FFPE 96X说明书

资料文件:OSFP0005FFPE_96X说明书.docx

易肽EasyPeptTM PTM

磷酸化富集试剂盒

货号:OSFP0005FFPE-200μg 规格:96x 版本号:V20260609

  1. 试剂盒包含

试剂名称 规格 简 介 储存条件
试剂0 ● 15 ml*2 裂解液,用于蛋白裂解 常温
磷酸酶抑制剂 200 μl 磷酸酶抑制剂 4℃避光
试剂A ● 270 μl*12 还原烷基化,蛋白质还原烷基化 -20℃
试剂B ● 270 μl*12 酶,蛋白酶解 -20℃
试剂C ● 1.3 ml*12 终止试剂,终止酶解反应 常温
WASH 0● 20 ml*3 肽段清洗试剂,去除掉多余的石蜡 常温
试剂D1 ● 20 ml*2 肽段清洗试剂1,清洗肽段 常温
试剂D2● 20 ml*2 肽段清洗试剂2,清洗肽段 常温
试剂E● 15 ml*1 肽段洗脱试剂 常温
试剂I 1.3 ml*4 调整buffer体系 4℃
试剂F ● 20ml*2 肽段清洗 4℃
试剂G ● 20 ml*1 肽段清洗 4℃
试剂H1 ● 500 μl*12 肽段洗脱 4℃
试剂H2 ● 500 μl*12 肽段洗脱 4℃
Cartridge 200 μg载量*96 肽段脱盐 常温
EnrichmentTip 200 μg载量*96 肽段富集 常温避光
S板 1(96X) 用于样品的还原烷基化、酶解 常温
Waste 板 1(96X) 脱盐废液收集 常温
Collection 板 1(96X) 洗脱肽段收集 常温
封口膜 1 96孔板封口 常温
Adaptor 1(96X) 96孔板除盐适配器(仅在首次购买96X试剂盒时附赠) 常温
  1. 试剂盒简介

样品制备是蛋白质组学实验最重要的步骤之一,合适的前处理过程是实验成功的关键。尤其翻译后修饰组学,由于含量低、不稳定的特性,对样本的保存、制备条件要求更为严格。

易肽EasyPeptTM PTM磷酸化富集试剂盒旨在以较低的样本初始量、较少的样品制备步骤和较短的操作时间获得最佳的实验结果。适用于石蜡切片等样本类型,尤其对于大队列样本的制备过程充分体现出其高通量、高稳健性的优势。该试剂盒提供磷酸化多肽制备包括蛋白变性、还原烷基化、蛋白酶解、肽段脱盐以及肽段富集过程的相关试剂。基于溶液内快速酶解的前处理方法,解决了传统方法样本用量多、试剂成本高、损失大、耗时长的弊端,仅需2-3小时即可完成肽段制备的步骤,且平行性好。基于离心式的肽段富集过程,操作简便,仅需0.5h即可完成肽段富集,以实现微量磷酸化肽段的快速制备及深度覆盖检测。

FFPE-磷酸化-最新

  1. 需要准备的试剂耗材

设备名称 简 介
移液器 吸取蛋白提取过程中的蛋白上清,减少污染物,提高蛋白定量准确度
恒温混匀仪 提供95℃及37℃的恒温条件,促进蛋白质的裂解与酶解
高通量组织研磨仪 不同组织样本的破碎,抽提蛋白质
冷冻/常温离心机 冷冻离心机用于蛋白提取,常温离心机用于肽段脱盐,适配器支持1.5/2ml离心管,高通量操作需要适配96孔板
真空离心浓缩仪 脱盐后的肽段干燥

4. 操作过程

4.1 蛋白提取

  1. 石蜡切片样本,根据石蜡切片的数量及组织分布的大小加入适量试剂 0,BeatBox/高通量组织研磨仪震荡研磨10min(BeatBox针对的是微量样本的研磨,所以石蜡切片的组织块不能太大,石蜡切片组织量大的样本建议用高通量组织研磨仪震荡研磨);(备注:如果组织大小在1cm*2cm左右,10μm厚度,建议样本中加入300μl试剂0)

  2. 震荡研磨结束后将样本转移至新的1.5ml离心管中,95℃,1000rpm震荡孵育30min;

  3. 孵育结束待样本恢复至室温后,瞬时离心,然后将枪头的头部剪掉一部分,将样本吹打混匀后取60μl样本进行后续实验。

4.2 蛋白酶解

a. 步骤4.1 c中得到的蛋白溶液(建议总体积不超过60μl,如果体积不到60μl请用试剂0补到60μl),加入试剂A 30 μl,吹打混匀,95℃加热2h(95℃,1000rpm);

b. 加热结束待样品恢复至室温后,分别加入30μl试剂B,混匀,37℃酶解3h (37℃,800 rpm);

c. 酶解结束后加入140 μl试剂C,混匀,终止酶解反应,瞬时离心一下。

4.3 肽段脱盐

  1. 加载样本:将样本全部加载到脱盐柱中,700g离心1min,重复操作一次;

  2. 除蜡:200μl试剂WASH 0加入到脱盐柱中,700g离心1min,重复操作一次;

  3. 脱盐柱清洗1:200μl 试剂D1加入到脱盐柱中,700g离心1min,重复操作一次;

  4. 脱盐柱清洗2:200μl 试剂D2加入到脱盐柱中,700g离心1min,重复操作一次;

  5. 样本洗脱:50μl 试剂E加入到脱盐柱中,700g离心1min,洗脱两次,最终样本体积为100μl;

  6. 洗脱的肽段中加入50μl试剂I,混匀;

  7. 真空冷冻离心浓缩仪浓缩样本(建议< 30℃)。(样本抽干后底部如有白色相关的沉淀也是正常的,可直接进行后续重悬、富集实验)

5.4 肽段富集(离心机全程室温)

  1. 将EnrichmentTip(富集柱)插入Adaptor上置于2ml离心管中;

  2. 150μl 试剂F加入到4.3干燥的肽段中,移液器上下吹打混匀8-10次,然后涡旋充分溶解样本;(涡旋混匀+超声波清洗机超声5min也是可以的)

  3. 50μl 试剂G加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  4. 50μl 试剂F加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min,弃掉流穿液;

  5. 将放有EnrichmentTip(富集柱)的Adaptor转移至新的2ml离心管中;

  6. 加载样本:将样本全部加载到富集柱中,2000g离心5min,流穿液重复过柱一次;

  7. 50μl 试剂F加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  8. 50μl 试剂G加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  9. 50μl 试剂F加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  10. 50μl 试剂G加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  11. 50μl LC-MS水加入到EnrichmentTip(富集柱)中,3000g离心1min;

  12. 将放有EnrichmentTip(富集柱)的Adaptor转移至新的EP管中(建议采用低吸附离心管);

  13. 样本洗脱:50μl 试剂H1加入到EnrichmentTip(富集柱)中,2000g离心5min;

  14. 样本洗脱:50μl 试剂H2加入到EnrichmentTip(富集柱)中,2000g离心5min;

  15. 真空离心浓缩仪浓缩样本(建议< 30℃)。

5. 注意事项

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