当然其中最贵的那部分,质谱是当仁不让的核心
那其他呢?前处理?液相?软件?生信?其实都很重要,每一步都得小心翼翼的保证其可靠性和高性能。
那今天我们就来推销下其中容易被忽视但又不可或缺的部分,反向色谱柱。
我们做蛋白质组的打交道最多的当然是C18反相色谱柱了,基本各大品牌都有其主打的色谱柱,同时也有大量实验室采购填料、自己制作空柱子使用。这边我们不再科普反相色谱原理,请自行百度百科。
让我们来列举下日常使用的问题,看看是不是你也会遇到:
价格,高性能的商品化柱当然美,但相应的价格也是令人望而却步,好不容易买了也得小心翼翼的使用,生怕不当心堵了那就只能去哭了;
长度,15cm的现在已经逐渐被抛弃,越来越多的用户开始希望20,25,30 甚至50cm的柱子,毕竟分离性能更好,如果成本和寿命可以不用管,自然谁都乐意用;
填料,柱子的直径、填料材质不同、颗粒大小都会影响柱子的整体性能,然而性能提高的同时,带来的问题一般是:系统柱压,寿命以及自己填柱子能不能稳定的填出性能优秀、稳定可靠的柱子?这些都是值得关切的问题。
在我平时接触的各个用户中,相当一部分是自己拉柱子、填柱子,其余大多是采购质谱公司推荐的商品柱。想要评估它们的性能,当然可以参考我们前一篇推文,使用QuiC软件来进行长期跟踪。
当然,你也可以了解下另一种填料的方式:一体型硅胶

其性能有材质和颗粒大小决定,然后性能越好、颗粒越小对系统要求越高,带来的是难以承受之柱压。
我们知道加上柱温箱自然可以缓解这个问题,但更长的柱子、更小的粒径和更高的柱温成了三方角力,必得有所妥协。


带来的直观改善便是比表面积更大,在相似的塔板数性能下,颗粒状填料色谱柱的柱压远远高于一体型填料色谱柱,这也是为何采用一体型硅胶色谱柱可以轻松实现4米甚至更长的柱长。
另外,一体型硅胶以坚实的结构装在色谱柱中,与色谱柱紧密结合,柱端无需使用筛板,绝对不会发生填料泄露的情况,减少了死体积,避免死体积引起的峰展 宽或者样品回收率低,提高色谱峰的对称性。

一体性硅胶填料孔隙率高,提高了液体流量,不会降低色谱柱的分离效率。较大的、复杂的分析样品,也可以进行快速分析,而无需担心样品分解。
柱压:在thermo Easy nLC 1000联用Lumos的质谱仪器上,我们采用一根内径0.1mm,填料孔径2um,50cm长的柱子,以600nl流速检测,柱压仅仅不到100Bar。

连续不间断使用3个月后,依然保持优秀的峰宽(~10s FWHM)以及检测结果(>5000PG 1%,1%,1%FDR, Hela 0.5ug,120min)。
当然用户最大的痛点就是你这个柱子寿命虽然长,但万一我样品有污染,这一堵柱子岂不是完蛋?对于这类填料与毛细管固定结合,不需要筛板的柱子来说只需要将末端堵塞部位切除1-2mm即可继续使用。而常规C18柱如果发生污染堵塞的情况,只能寄希望于流动相冲洗或者更换。
对于一根50cm,1m甚至4m的柱子,切掉末端1mm,2mm甚至1cm,对性能影响微乎其微。这也是成本的重要组成部分。
另外,现在订购这款色谱柱,随柱子附赠iRT肽段以及质控软件QuiC哦。