通过使用影响分析的新型分析方法,iPathwayGuide 考虑了通路中每个基因的作用、位置和关系, 从而显著降低假阳性,并更好地识别真正受影响的通路,和可以解释基因表达变化的可能机制。
(二)通路显著性分析的几种策略
通路分析已经成为研究复杂疾病的热点,分析上有三种策略。前两种最常用,但是只考虑了通路中的基因,不考虑通路中基因的互作关系和类型。
iPathwayGuide属于哪种?ORA + PT
筛选关键基因,通路和网络分析都是好工具。
通路分析怎么筛选关键基因?四步。
这篇文章2019年发表,今年是2022年。 当下各种注释库都已经有了很大的更新。而且,这个关键基因,并不是在所有的这类患者体内都高表达的,如果低表达,那这些患者怎么办呢?所以我们想以这个文章为例,让iPathwayGuide这个工具,看看其他用药可能性。