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HMDB Local

HMDB 本地代谢物库

面向代谢物注释、PubChem 联合匹配、结构和谱图扩展的本地数据库。优先建设 Metabolites XML 与 SDF 结构库。

Build Status

数据库状态与查询

支持 HMDB ID、PubChem CID、InChIKey 和名称检索;多行输入或 TSV/CSV 自动批量匹配。

HMDB 数据状态

正在读取 HMDB 状态...

HMDB 查询

输入一行返回单条结果;输入多行或 TSV/CSV 表格返回批量结果。

Scope

第一阶段功能范围

离线索引

MetabolitesHMDB ID、名称、同义词、Formula、Mass、SMILES、InChIKey。
TaxonomySuperclass、class、subclass、direct parent。
Biospecimen血清、尿液、CSF、唾液等出现来源。
StructureSDF 结构本地缓存,后续可与 PubChem 结构视图合并。

整合计划

PubChem 联合优先按 InChIKey 映射 CID 与 HMDB ID。
详情展示本地显示 HMDB 代谢物摘要;完整页面链接到 HMDB 官网。
谱图扩展实验 MS/MS XML 和谱图图片作为第二阶段。
许可HMDB 数据按非商业许可使用,页面保留来源和引用提示。