中文名称与 AI 补充检索
UniProt 物种检索可补充 Taxonomy ID、近缘 Proteome 和外部 FASTA 线索；代谢物中文名无直接结果时可尝试补充规范名称，命中本地 PubChem、HMDB 或 ChEBI 记录后保存为检索别名。
使用代谢物中文检索数据库检索
选择数据库工作台、序列库指南或培训手册，完成项目建库、ID 标准化、中文名称检索、批量匹配和结果复核。
Release Notes
数据库检索版本更新
汇总近期可直接使用的检索、构库、培训和结果复核能力。更新内容以实际页面与数据接口为准。
常见污染物及标志蛋白指南
统一整理经典污染蛋白、EV 与血细胞相关标志蛋白、人源体液蛋白、PQ500 和 TOP14，支持按物种和分类筛选、表格复核及 FASTA 下载。
构建场景化 FASTA培训与实操联动
UniProt 中文培训按章节讲解 FASTA、数据库分工、DDA/DIA 搜库、ID Mapping 和 API，并可从课程示例直接打开对应的本地检索与分析页面。
打开 UniProt 使用培训分享、缓存与跨端复用
查询条件可随专属链接分享；本地缓存记录来源和获取时间，到期后可主动刷新。网页、Omics Express App 与站内模块可保持一致的检索结果和分享体验。
进入 UniProt Browser查看前几周更新记录 2026.06.29–07.19
UniProt 本地分析与在线培训完善
- 单蛋白详情可直接进入蛋白序列分析，支持多种酶切、Motif、肽段匹配、理化性质和结果导出。
- 增加 2–10 条蛋白序列比对、ID Mapping、Feature/Structure 信息缓存及本地可视化。
- 培训内容改为分章节加载，并把 FASTA 结构、数据库来源和搜库原理与站内实操连接起来。
- 建立污染物与标志蛋白专题入口，开始统一序列分类、来源说明和 FASTA 下载。
Proteome 检索、中文兼容与批量工作流完善
- 统一支持 Proteome ID、Taxon ID、拉丁名、中文名、英文俗名、accession 和 Gene 查询。
- 没有直接 Proteome 时，按分类谱系在最近祖先分支的子节点中寻找候选，并明确标记近似匹配。
- 精确或近似结果存在多个 Proteome 时提供候选选择，默认优先蛋白数量更多的记录。
- 批量表格统一搜索、筛选、分页、页码跳转和全部结果导出，FASTA 打包不受当前页或预览条数限制。
代谢物三库合并查询与数据库总入口建立
- 建立 HMDB、PubChem、ChEBI 本地统一查询，支持名称、同义词、稳定 ID、InChIKey 和 SMILES。
- 单条结果整合结构、分子式、质量、分类和官方来源；批量结果支持候选排序及 TSV/CSV 导出。
- 数据库检索成为顶层总入口，集中呈现蛋白质组、代谢物、培训和序列库指南。
Protein Database
UniProt 蛋白质组与蛋白条目库
面向 FASTA 获取、蛋白质组选择和 UniProtKB 条目复核。本地增强层支持中文物种名、英文俗名、Taxon ID、Proteome ID 和 accession 的统一检索；中文兼容是本站补充能力，并非 UniProt 官方字段。
数据概览
2026_02当前默认 release保留历史版本用于复核
36,466Proteomes蛋白质组记录
74,728本地文件FASTA / XML / mapping
147,131,808UniProtKB 条目本地注释索引
75,712物种别名本站增强：中文/英文俗名与拉丁同义名
2,854中文物种名TaxID 对齐、人工复核与父物种继承
可完成的任务
| 蛋白质组定位 | 按 Proteome ID、Taxon ID、拉丁名、中文名或英文俗名检索可用 proteome。 |
| 近缘匹配 | 输入物种没有直接 proteome 时，在最近可用分类分支中提示可接受的近似候选。 |
| FASTA 获取 | 单个或批量 proteome 可下载主库、异构体或完整 FASTA。 |
| 条目复核 | 按 accession、基因、蛋白名、物种、Taxon ID 和 Proteome ID 浏览 UniProtKB 条目。 |
| 物种列表 | 查看分类大类下的 proteome 列表，并下载中英文对照表。 |
| 污染物序列库 | 查看 contaminants2021 的完整统计、序列详情和来源分类，并下载全部或选中的 FASTA。 |
| 使用培训 | 学习 FASTA 来源与结构、本地 UniProt 实操、DDA/DIA 搜库原理、FDR、ID Mapping 和 API。 |
Metabolite Database
代谢组数据库
面向小分子和代谢物的本地合并查询，统一识别 HMDB ID、PubChem CID、ChEBI ID、InChIKey、SMILES、名称和同义词，结果可用于批量 ID 标准化和候选复核。
数据概览
217,920HMDB 代谢物本地 HMDB
1,271,922HMDB 同义词名称检索
104,230HMDB-PubChem 映射CID 互通
205,304ChEBI 化合物本地 ChEBI
386,425ChEBI 同义词名称检索
399,306ChEBI 外部 ID库间映射
171ChEBI-PubChem 映射CID 互通
19,791ChEBI-HMDB 映射HMDB 互通
182,783ChEBI InChIKey精确匹配
178,292,117PubChem 化合物CID 范围
178,292,117PubChem 结构字段SMILES 索引
123,881,701PubChem 属性Formula / Mass
132,946,371PubChem IUPACIUPAC 名称
41,179,788PubChem 文献PMID
502,300,003PubChem 专利Patent
386,351,121PubChem SID 来源记录SID
256,901PubChem LCSSLCSS
324,736,386PubChem 注释记录Date / Parent
96,402PubChem MeSHCID-MeSH
11,489PubChem 药理MeSH-Pharm
179,537PubChem ChEBICID-ChEBI
205,304ChEBI 术语Ontology
1,149,159PubChem DSSToxDTXSID
96,402MeSH 词条Compound
可完成的任务
| 单条查询 | 输入 HMDB ID、CID、ChEBI ID、InChIKey、SMILES 或名称返回合并详情。 |
| 批量比对 | 多行或 TSV/CSV 输入返回统一批量表，并保留候选排序。 |
| 库间互通 | 同步显示 HMDB、PubChem 和 ChEBI 对应 ID、名称、结构和分类字段。 |
| 结果复核 | 结果中保留 HMDB、PubChem 与 ChEBI 官方页面入口。 |
| 导出结果 | 批量表支持 TSV 和 CSV 导出，便于项目表格回填。 |