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Human organ proteome map

人体器官蛋白质组图谱

查看人体器官 protein group 检出、器官定量、重复层级证据、器官间差异、样品 TIC/BPC 和蛋白详情。

器官: 生物学重复: 检出规模:

Human organ proteome map

人体器官图谱

该模块按器官系统查看 protein group 检出规模、器官表达谱、候选蛋白在多器官中的分布,并支持器官间差异对比。

Function background

器官图谱怎么读

  1. 1选器官看 PG 检出和平均定量。
  2. 2看重复进入 TIC/BPC 与样品 QC。
  3. 3找蛋白进入背景页或蛋白详情页。
  4. 4追证据序列覆盖、MS2、XIC、肽段。
器官生物学重复Protein groupPeptidePrecursor 证据

生物学重复

在人体图谱中点击器官后,可按生物学重复进入单样品 TIC/BPC 色谱曲线;样品选择统一使用器官和重复编号。

选择器官与重复 样品 TIC/BPC

横轴为器官,纵轴可切换总 PG 或平均 PG / 样品。可用鼠标滚轮或下方缩放条放大局部区域。

器官蛋白定量详表

选择一个器官后,表格列出该器官中的 protein group、gene、描述、平均 log2 intensity,以及各 replicate 的 log2 intensity。

自定义显示列

结果解读边界

人体器官图谱用于查看器官表达谱覆盖、候选蛋白分布和结果下钻入口;不能把该测试数据直接解释为样品分组效应。

Differential comparison

两个器官怎么比较

  1. 1两器官目标器官 vs 对照器官。
  2. 2重复检验基于 R1/R2/R3 表达值。
  3. 3阈值筛选log2FC + P 值。
  4. 4图表追踪火山、热图、PCA、相关性。
器官 A 重复器官 B 重复log2FC / P候选蛋白证据下钻

器官差异对比选择

选择一个比较器官和一个对照器官后,按两组 replicate 的 log2 intensity 计算 log2FC、P 值、火山图、热图、PCA 和 Pearson 相关性。

表格筛选

自定义显示列

结果解读边界

器官间差异对比用于查看两个器官之间的表达差异、候选蛋白分布和重复间一致性;结果解释应基于器官来源和重复质量,不应延伸为疾病或处理效应。