Function background
器官图谱怎么读
- 1选器官看 PG 检出和平均定量。
- 2看重复进入 TIC/BPC 与样品 QC。
- 3找蛋白进入背景页或蛋白详情页。
- 4追证据序列覆盖、MS2、XIC、肽段。
器官生物学重复Protein groupPeptidePrecursor 证据
Human organ proteome map
查看人体器官 protein group 检出、器官定量、重复层级证据、器官间差异、样品 TIC/BPC 和蛋白详情。
Human organ proteome map
该模块按器官系统查看 protein group 检出规模、器官表达谱、候选蛋白在多器官中的分布,并支持器官间差异对比。
Function background
按器官查看 protein group 检出、平均定量、器官表达谱和蛋白详情入口。
在人体图谱中点击器官后,可按生物学重复进入单样品 TIC/BPC 色谱曲线;样品选择统一使用器官和重复编号。
横轴为器官,纵轴可切换总 PG 或平均 PG / 样品。可用鼠标滚轮或下方缩放条放大局部区域。
选择一个器官后,表格列出该器官中的 protein group、gene、描述、平均 log2 intensity,以及各 replicate 的 log2 intensity。
人体器官图谱用于查看器官表达谱覆盖、候选蛋白分布和结果下钻入口;不能把该测试数据直接解释为样品分组效应。
Differential comparison
选择一个比较器官和一个对照器官后,按两组 replicate 的 log2 intensity 计算 log2FC、P 值、火山图、热图、PCA 和 Pearson 相关性。
器官间差异对比用于查看两个器官之间的表达差异、候选蛋白分布和重复间一致性;结果解释应基于器官来源和重复质量,不应延伸为疾病或处理效应。