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UniProt 本地数据库

UniProt 浏览与 FASTA 获取

使用 Proteome ID、Taxon ID、物种中文名、拉丁名或蛋白标识符检索本地数据库;需要时自动补充 UniProt 官网字段与中英文物种信息。

正在读取数据库概览...
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按常用物种选择

点击分类展开物种列表;选择物种后直接查询当前 Release。

正在准备常用物种...
多行输入或表格文件会自动生成批量匹配结果。
当前
Release 读取中 等待查询

尚未选择 Proteome

选择 Proteome 后,可从顶部模块栏进入文件与预览,查看本地 FASTA、XML、mapping 和注释文件。

文件预览区域

FASTA/text 文件显示文本预览;Full_BioChem 注释 CSV 进入可筛选表格浏览。

请在上方查询 Proteome、Taxon、拉丁名、中文名或英文俗名,并点击结果标题中的 Proteome ID;详情会同步限定下方 UniProtKB 条目库。

UniProtKB local entries

UniProtKB 条目库

浏览当前本地注释库中的蛋白条目,按 accession、基因、蛋白名、物种、Taxon ID、Proteome ID 和注释状态筛选后进入单个蛋白详情。

条目库查询使用分页返回结果;Taxon ID、Organism 和 Proteome ID 由上方 Proteome 或物种查询结果自动限定。

UniProtKB entry

单个蛋白质浏览

按 UniProtKB 条目页的阅读结构展示可读取的注释信息,包括名称与分类、功能、定位、疾病、特征类型、GO、交叉引用、文献和序列。

输入 Accession 可直接载入;输入 gene symbol 或关键词时显示候选条目。

Proteome FASTA analysis

蛋白组 FASTA 分析工作台

面向当前 Proteome 的全库序列搜索;支持单条氨基酸肽段匹配和 motif 检索,不进行 MS/MS 谱图鉴定。

1

Proteome 范围

进入本模块时优先自动载入当前 Proteome 的 canonical FASTA。

当前未载入 Proteome FASTA。
2

序列检索

肽段匹配直接在指定 Proteome FASTA 中搜索,返回蛋白 accession 和 1-based 位置。

3

Motif 检索

基于当前 Proteome FASTA 搜索氨基酸基序或正则表达式。

未载入 FASTA。选择 Proteome 后进入本模块会优先自动载入 canonical FASTA。

Custom protein matching

个性化蛋白匹配工作台

面向用户自定义 FASTA 的序列分析;可粘贴 FASTA,也可从文件列表或 UniProtKB 单蛋白详情载入后进行统计、FASTA header 规则识别、理论酶切和理化性质计算。

1

自定义 FASTA

粘贴 FASTA 文本,或从 Proteome 文件列表、单蛋白详情载入后再做个性化分析。

可粘贴 FASTA,或从单蛋白详情 / 文件列表载入后分析。
2

理论酶切

选择常用蛋白酶规则,按漏切数和肽段长度输出理论肽段。

UniProt ID mapping

ID 候选映射

基于当前本地 UniProtKB 注释库查找 accession、gene、RefSeq、Ensembl、GeneID、Proteome 等标识符的候选对应关系。

输入一列或多列 ID 后查找候选映射;结果可继续进入条目详情。

Protein sequence analysis

蛋白序列分析

在同一工作区完成蛋白序列理化性质、氨基酸组成、原子组成、分子式、消光系数、吸光度、局部窗口疏水性、电荷分析和小规模序列比对;FASTA 载入、计算和可视化均基于本地库与本地实现,比对需提供 2-10 个蛋白。

序列性质与组成

适合单蛋白或少量蛋白序列的本地计算与本地可视化。