SpectroDive 图谱

SpectroDive 界面、方法开发与定量结果图谱

SpectroDive 的图谱按靶向验证 workflow 排列：基础环境、谱库、panel 设计、方法导出、Analysis、绝对定量、报表、QC 与附录图表可连续查看，也可通过模块索引直接定位。

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基础环境与界面

先确认临时目录、Search Archive、右键菜单和界面区域。后续 panel、分析和报表操作都建立在这些界面结构上。

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Pulsar、外部搜索引擎、外部谱库、labeled library 和 spike-in library 共同决定 panel 的信息来源和质量上限。

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Prepare 模块把 spectral library 或序列列表转化为可执行的 PRM/MRM panel，并继续完成 RT 校准、调度窗口和方法导出。

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Analysis 模块用于检查 fragment ion、interference score、integration boundary、iRT refinement 和 calibration curve，是绝对定量成立的关键环节。

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Post Analysis、Report 和 QC 将候选、校准曲线、run-level 质量状态和交付字段连接起来，适合用于 targeted verification 的结果复核。

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FASTA、modification、cleavage rule、settings schema 和 parsing rule 决定数据库解释、命名规则和批处理一致性。

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附录图表覆盖 iRT calibration、XIC、fragment intensity、cross-run RT accuracy、data completeness、CV、SureQuant scans、heatmap 与 volcano plot。