按常用物种选择
点击分类展开物种列表;选择物种后直接查询当前 Release。
UniProt 本地数据库
使用 Proteome ID、Taxon ID、物种中文名、拉丁名或蛋白标识符检索本地数据库;需要时自动补充 UniProt 官网字段与中英文物种信息。
点击分类展开物种列表;选择物种后直接查询当前 Release。
选择 Proteome 后,可从顶部模块栏进入文件与预览,查看本地 FASTA、XML、mapping 和注释文件。
FASTA/text 文件显示文本预览;Full_BioChem 注释 CSV 进入可筛选表格浏览。
UniProtKB local entries
浏览当前本地注释库中的蛋白条目,按 accession、基因、蛋白名、物种、Taxon ID、Proteome ID 和注释状态筛选后进入单个蛋白详情。
UniProtKB entry
按 UniProtKB 条目页的阅读结构展示可读取的注释信息,包括名称与分类、功能、定位、疾病、特征类型、GO、交叉引用、文献和序列。
Proteome FASTA analysis
面向当前 Proteome 的全库序列搜索;支持单条氨基酸肽段匹配和 motif 检索,不进行 MS/MS 谱图鉴定。
Custom protein matching
面向用户自定义 FASTA 的序列分析;可粘贴 FASTA,也可从文件列表或 UniProtKB 单蛋白详情载入后进行统计、FASTA header 规则识别、理论酶切和理化性质计算。
粘贴 FASTA 文本,或从 Proteome 文件列表、单蛋白详情载入后再做个性化分析。
选择常用蛋白酶规则,按漏切数和肽段长度输出理论肽段。
UniProt ID mapping
基于当前本地 UniProtKB 注释库查找 accession、gene、RefSeq、Ensembl、GeneID、Proteome 等标识符的候选对应关系。
Protein sequence analysis
在同一工作区完成蛋白序列理化性质、氨基酸组成、原子组成、分子式、消光系数、吸光度、局部窗口疏水性、电荷分析和小规模序列比对;FASTA 载入、计算和可视化均基于本地库与本地实现,比对需提供 2-10 个蛋白。