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第 5 章

5. BGMS Raw API

理解 BGMS Raw API 的用途,并把它放在原始数据访问、接口开发和二次分析语境中。

本章小节

本章内容

小节 5

5 BGMS Raw API

本节覆盖 BGMS Raw API 用途、原始数据访问、接口开发、二次分析集成 等内容,重点是把功能入口、输入资源、设置边界和结果检查方式对应起来。

功能定位

BGMS Raw API 为原始数据访问和接口开发提供基础能力,适合深度可视化、二次开发和自动化工具。

使用流程

  1. 确认要读取的数据层级。
  2. 通过 API 访问 raw-level 信息。
  3. 将读取结果与 run、precursor、fragment 或 XIC 语义对应。

判断与注意事项

  • API 输出能与 Spectronaut report 或 XIC DB 中的对象对应。
  • 读取底层数据后不回到生物学和分析层级解释。
  • 确认输入、输出、设置和结果解释边界。

功能点说明

  • BGMS Raw API 用途
  • 原始数据访问
  • 接口开发
  • 二次分析集成

功能条目 1:Raw API 需要作为本节的功能点核对。使用时重点确认它对应的入口、输入来源、设置含义、输出文件或图谱,以及是否与当前项目的 run、condition、library、FASTA、settings 和 report schema 保持一致。

功能条目 2:原始数据访问(操作场景 2) 需要作为本节的功能点核对。使用时重点确认它对应的入口、输入来源、设置含义、输出文件或图谱,以及是否与当前项目的 run、condition、library、FASTA、settings 和 report schema 保持一致。

功能条目 3:接口开发(操作场景 3) 需要作为本节的功能点核对。使用时重点确认它对应的入口、输入来源、设置含义、输出文件或图谱,以及是否与当前项目的 run、condition、library、FASTA、settings 和 report schema 保持一致。

功能条目 4:DIA 需要作为本节的功能点核对。使用时重点确认它对应的入口、输入来源、设置含义、输出文件或图谱,以及是否与当前项目的 run、condition、library、FASTA、settings 和 report schema 保持一致。

功能条目 5:BGMS Raw API 用途(操作场景 5) 需要作为本节的功能点核对。使用时重点确认它对应的入口、输入来源、设置含义、输出文件或图谱,以及是否与当前项目的 run、condition、library、FASTA、settings 和 report schema 保持一致。